More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3656 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  68.37 
 
 
531 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  79.38 
 
 
516 aa  773    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  87.16 
 
 
523 aa  843    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  84.78 
 
 
520 aa  835    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  86.1 
 
 
518 aa  864    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  68.17 
 
 
531 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  67.44 
 
 
531 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
519 aa  1040    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.34 
 
 
675 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.03 
 
 
679 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.6 
 
 
681 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  48.34 
 
 
686 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.26 
 
 
683 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 
686 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.86 
 
 
690 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
686 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.14 
 
 
678 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.95 
 
 
686 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
676 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
675 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.73 
 
 
678 aa  392  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 
687 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.09 
 
 
685 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
681 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
681 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.99 
 
 
681 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.79 
 
 
681 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.47 
 
 
684 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.74 
 
 
679 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 
691 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.11 
 
 
688 aa  375  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.16 
 
 
695 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.02 
 
 
678 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
678 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
674 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 
690 aa  359  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  45.33 
 
 
517 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.47 
 
 
682 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.03 
 
 
686 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
683 aa  355  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.66 
 
 
664 aa  355  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
836 aa  353  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  38.16 
 
 
683 aa  351  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.32 
 
 
703 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 
684 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
683 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
706 aa  337  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 
684 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.34 
 
 
702 aa  334  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 
684 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  28.95 
 
 
470 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  26.25 
 
 
505 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  27.2 
 
 
486 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.23 
 
 
486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  27.71 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  27.07 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  27.31 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  28.9 
 
 
490 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  27.5 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
495 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4410  Aldehyde Dehydrogenase  31.1 
 
 
491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  27.71 
 
 
476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  27.65 
 
 
490 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  26.78 
 
 
485 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
503 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.2 
 
 
481 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  27.67 
 
 
798 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  25.63 
 
 
500 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  27.05 
 
 
490 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  26.78 
 
 
463 aa  106  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  24.95 
 
 
512 aa  107  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  28.97 
 
 
489 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.54 
 
 
491 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  27.2 
 
 
505 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  26.26 
 
 
505 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  26.76 
 
 
510 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  25.35 
 
 
517 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  25.25 
 
 
477 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  27.85 
 
 
505 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  25.74 
 
 
497 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
478 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  26.18 
 
 
478 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.48 
 
 
484 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  26.71 
 
 
477 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06180  betaine aldehyde dehydrogenase  25.31 
 
 
486 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  28.7 
 
 
477 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  28.32 
 
 
478 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  28.32 
 
 
478 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.35 
 
 
479 aa  103  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5206  2-aminomuconic 6-semialdehyde dehydrogenase  26.43 
 
 
487 aa  103  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.532716  normal  0.251126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  27.05 
 
 
490 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.8 
 
 
496 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  27.57 
 
 
490 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  27.05 
 
 
490 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.28 
 
 
486 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.48 
 
 
483 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.6 
 
 
482 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  28.88 
 
 
490 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  26.85 
 
 
490 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.38 
 
 
482 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>