More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0094 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53 
 
 
687 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.03 
 
 
685 aa  656    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.67 
 
 
690 aa  665    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.04 
 
 
678 aa  696    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.94 
 
 
686 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.78 
 
 
675 aa  751    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.44 
 
 
691 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
688 aa  1349    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.34 
 
 
676 aa  637    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.74 
 
 
703 aa  646    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 
683 aa  716    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.07 
 
 
686 aa  656    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.68 
 
 
681 aa  778    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.22 
 
 
686 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.87 
 
 
706 aa  630  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  48.37 
 
 
679 aa  631  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.32 
 
 
675 aa  628  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.58 
 
 
678 aa  625  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.67 
 
 
664 aa  620  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.69 
 
 
695 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.23 
 
 
702 aa  615  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.01 
 
 
679 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.49 
 
 
686 aa  600  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.3 
 
 
678 aa  596  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.67 
 
 
674 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.17 
 
 
678 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.97 
 
 
684 aa  571  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.44 
 
 
690 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.28 
 
 
681 aa  552  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.08 
 
 
683 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.89 
 
 
682 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.28 
 
 
681 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.28 
 
 
681 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.65 
 
 
683 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
681 aa  548  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.39 
 
 
686 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.45 
 
 
684 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.9 
 
 
683 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.45 
 
 
684 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.6 
 
 
684 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  43.15 
 
 
836 aa  526  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  44.36 
 
 
518 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
516 aa  357  5.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 
520 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  43.11 
 
 
519 aa  354  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
531 aa  350  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
531 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
531 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
523 aa  342  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  43.86 
 
 
517 aa  336  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  48.35 
 
 
515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
487 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  29.2 
 
 
506 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  34.48 
 
 
488 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  32.87 
 
 
512 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  27.71 
 
 
496 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  27.71 
 
 
496 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1782  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  32.41 
 
 
507 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  30.45 
 
 
485 aa  114  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  31.94 
 
 
517 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.8 
 
 
523 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.8 
 
 
523 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.8 
 
 
502 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  34.48 
 
 
472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.17 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2366  aldehyde dehydrogenase  30.61 
 
 
508 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  31.9 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  34.75 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2005  aldehyde dehydrogenase  32.91 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  29.37 
 
 
510 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3506  Aldehyde Dehydrogenase  29.54 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  34.04 
 
 
470 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1089  aldehyde dehydrogenase  30.86 
 
 
507 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.89 
 
 
481 aa  111  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  30.61 
 
 
505 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5200  aldehyde dehydrogenase  33.61 
 
 
493 aa  110  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2967  aldehyde dehydrogenase  27.97 
 
 
501 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.339954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  31.16 
 
 
498 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  30.51 
 
 
500 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4340  aldehyde dehydrogenase  32.71 
 
 
513 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0524218  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2944  aldehyde dehydrogenase  30.24 
 
 
506 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.09 
 
 
477 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  31.12 
 
 
483 aa  108  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  32.04 
 
 
474 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  33.99 
 
 
488 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  29.49 
 
 
496 aa  108  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  32.01 
 
 
491 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3621  aldehyde dehydrogenase  29.46 
 
 
506 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.096261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4441  aldehyde dehydrogenase  30.72 
 
 
506 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.896432  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0387  aldehyde dehydrogenase family protein  26.09 
 
 
473 aa  107  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  32.19 
 
 
517 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.522352  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3281  aldehyde dehydrogenase  29.08 
 
 
505 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  32.01 
 
 
491 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2361  aldehyde dehydrogenase  35.07 
 
 
683 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.202698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1095  aldehyde dehydrogenase  29.03 
 
 
506 aa  107  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.298073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2968  aldehyde dehydrogenase  33.57 
 
 
482 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  32.01 
 
 
491 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0366  aldehyde dehydrogenase  32.53 
 
 
506 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141497  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3377  aldehyde dehydrogenase  33.92 
 
 
482 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  31.12 
 
 
484 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>