More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0907 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.63 
 
 
681 aa  753    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.98 
 
 
690 aa  756    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.77 
 
 
686 aa  802    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 
683 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.07 
 
 
686 aa  732    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
687 aa  1372    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.84 
 
 
703 aa  705    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.83 
 
 
679 aa  756    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.59 
 
 
706 aa  650    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.52 
 
 
678 aa  795    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.79 
 
 
686 aa  785    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.61 
 
 
686 aa  741    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.78 
 
 
675 aa  818    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.06 
 
 
675 aa  735    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  70.71 
 
 
678 aa  935    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 
664 aa  728    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.74 
 
 
674 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 
702 aa  683    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.71 
 
 
684 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  71.79 
 
 
678 aa  973    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  84.47 
 
 
685 aa  1132    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.04 
 
 
691 aa  741    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.41 
 
 
678 aa  733    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.24 
 
 
695 aa  668    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.77 
 
 
676 aa  794    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53 
 
 
688 aa  652    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  72.19 
 
 
679 aa  971    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.63 
 
 
683 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.2 
 
 
682 aa  661    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.08 
 
 
686 aa  673    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.51 
 
 
690 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 
681 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.53 
 
 
683 aa  617  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.04 
 
 
684 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 
681 aa  618  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.89 
 
 
684 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.65 
 
 
681 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.04 
 
 
684 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.5 
 
 
681 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.44 
 
 
683 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  48.16 
 
 
836 aa  596  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  47.06 
 
 
531 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
531 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
531 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  45.95 
 
 
519 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
518 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  46.03 
 
 
517 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
523 aa  365  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
516 aa  362  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  45.66 
 
 
520 aa  360  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  51.41 
 
 
515 aa  183  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  34.25 
 
 
487 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  28.79 
 
 
485 aa  122  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  29.28 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  24.83 
 
 
477 aa  117  8.999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  30.85 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.1 
 
 
496 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  31.09 
 
 
476 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  28.67 
 
 
477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  30.71 
 
 
476 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  30.42 
 
 
476 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  29 
 
 
474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  25.96 
 
 
488 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  27.46 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  27.46 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.65 
 
 
481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  28.05 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  26.67 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  28.6 
 
 
463 aa  112  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  30.16 
 
 
490 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0375  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.89 
 
 
1049 aa  112  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.696802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  28.32 
 
 
517 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
496 aa  110  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5498  aldehyde dehydrogenase  30.04 
 
 
487 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  26.74 
 
 
510 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1768  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.24 
 
 
1002 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.12 
 
 
476 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  28.43 
 
 
499 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2507  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.78 
 
 
496 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.982399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2462  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.78 
 
 
496 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.1149  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0819  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.54 
 
 
1052 aa  108  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3083  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.64 
 
 
499 aa  108  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  28.3 
 
 
479 aa  107  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  31.85 
 
 
477 aa  107  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  24.89 
 
 
479 aa  107  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.98 
 
 
496 aa  107  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  28.04 
 
 
478 aa  107  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.98 
 
 
496 aa  107  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  26.4 
 
 
477 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0667  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.61 
 
 
1044 aa  107  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  27.32 
 
 
485 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  29.16 
 
 
478 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  27.13 
 
 
491 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0870  Aldehyde Dehydrogenase  26.53 
 
 
528 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  29.62 
 
 
476 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 
494 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  28.48 
 
 
495 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  25.19 
 
 
475 aa  105  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  26.68 
 
 
490 aa  105  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.76 
 
 
496 aa  105  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>