More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2485 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  49.41 
 
 
686 aa  641    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.93 
 
 
706 aa  696    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
683 aa  1350    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.35 
 
 
702 aa  716    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  64.55 
 
 
686 aa  822    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  65.68 
 
 
681 aa  840    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  61.83 
 
 
678 aa  801    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.88 
 
 
678 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 
687 aa  677    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.49 
 
 
664 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.72 
 
 
674 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.06 
 
 
678 aa  695    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.88 
 
 
678 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.36 
 
 
691 aa  697    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.1 
 
 
695 aa  637    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.65 
 
 
676 aa  725    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.54 
 
 
690 aa  714    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  67.46 
 
 
675 aa  850    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.25 
 
 
686 aa  749    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 
688 aa  710    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 
685 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.27 
 
 
703 aa  728    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 
675 aa  699    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.14 
 
 
679 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.52 
 
 
686 aa  747    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  49.56 
 
 
679 aa  652    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.85 
 
 
684 aa  621  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.16 
 
 
683 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.47 
 
 
686 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.85 
 
 
682 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.88 
 
 
684 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.29 
 
 
684 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.9 
 
 
681 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.04 
 
 
681 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.44 
 
 
684 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.88 
 
 
683 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  48.9 
 
 
681 aa  571  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.75 
 
 
681 aa  571  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.23 
 
 
690 aa  571  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
683 aa  561  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  45.1 
 
 
836 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  45.72 
 
 
518 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  44.68 
 
 
531 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  45.37 
 
 
519 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  46.62 
 
 
516 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  43.65 
 
 
531 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 
531 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  44.9 
 
 
520 aa  349  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
523 aa  345  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  42.29 
 
 
517 aa  307  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  49.72 
 
 
515 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  29.01 
 
 
487 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.85 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  27.68 
 
 
476 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  27.9 
 
 
476 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  25.6 
 
 
788 aa  109  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.04 
 
 
481 aa  108  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  30.03 
 
 
798 aa  107  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  26.32 
 
 
475 aa  106  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  26.27 
 
 
496 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  26.27 
 
 
496 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  25.76 
 
 
475 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  25.76 
 
 
475 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  27.35 
 
 
476 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  27.58 
 
 
476 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
498 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  25.66 
 
 
506 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0096  aldehyde dehydrogenase  29.21 
 
 
780 aa  101  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493554  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5222  Betaine-aldehyde dehydrogenase  29.02 
 
 
494 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  28.38 
 
 
488 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4997  Aldehyde Dehydrogenase  26.74 
 
 
474 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201022  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0786  aldehyde dehydrogenase  29.81 
 
 
779 aa  100  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0387  aldehyde dehydrogenase family protein  25.25 
 
 
473 aa  99.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0728  aldehyde dehydrogenase family protein  29.3 
 
 
506 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  26.11 
 
 
490 aa  99.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  27.79 
 
 
529 aa  99.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0313  aldehyde dehydrogenase  25.73 
 
 
792 aa  98.6  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7969  Betaine-aldehyde dehydrogenase  26.65 
 
 
477 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  31.69 
 
 
470 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3731  aldehyde dehydrogenase  30.73 
 
 
493 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  25.16 
 
 
496 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  26.36 
 
 
495 aa  95.9  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0629  aldehyde dehydrogenase  29.03 
 
 
506 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4440  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  24.8 
 
 
511 aa  96.3  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3718  aldehyde dehydrogenase  30.46 
 
 
495 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3791  aldehyde dehydrogenase  30.46 
 
 
493 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0604454  normal  0.0877723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  27.87 
 
 
505 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0437  aldehyde dehydrogenase  29.69 
 
 
457 aa  95.5  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.888266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  29.09 
 
 
474 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3377  aldehyde dehydrogenase  31.56 
 
 
482 aa  95.1  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.58 
 
 
493 aa  95.1  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4158  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  24.75 
 
 
511 aa  95.1  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  30.71 
 
 
474 aa  95.1  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3725  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
502 aa  95.1  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  25.92 
 
 
490 aa  95.1  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  25.69 
 
 
783 aa  95.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  27.5 
 
 
491 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  26.2 
 
 
470 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.62 
 
 
483 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0875  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.75 
 
 
483 aa  94.4  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>