More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1832 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.11 
 
 
681 aa  722    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.88 
 
 
702 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.5 
 
 
686 aa  731    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.25 
 
 
690 aa  742    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.44 
 
 
675 aa  801    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.18 
 
 
678 aa  727    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.9 
 
 
682 aa  673    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.65 
 
 
686 aa  698    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.8 
 
 
706 aa  653    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.16 
 
 
686 aa  763    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  86.39 
 
 
678 aa  1149    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.48 
 
 
664 aa  707    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.02 
 
 
674 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.67 
 
 
686 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
678 aa  1364    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.3 
 
 
683 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.91 
 
 
679 aa  729    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.14 
 
 
691 aa  746    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  69.23 
 
 
685 aa  926    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.69 
 
 
695 aa  656    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.49 
 
 
676 aa  785    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  86.54 
 
 
679 aa  1161    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.88 
 
 
683 aa  687    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
684 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  71.79 
 
 
687 aa  961    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.66 
 
 
703 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.33 
 
 
678 aa  789    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.96 
 
 
686 aa  772    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.06 
 
 
675 aa  713    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.11 
 
 
683 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.93 
 
 
690 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.66 
 
 
684 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 
684 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.58 
 
 
688 aa  622  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.22 
 
 
684 aa  625  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.65 
 
 
683 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.52 
 
 
681 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.52 
 
 
681 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.36 
 
 
681 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.21 
 
 
681 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  44.13 
 
 
836 aa  543  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  46.3 
 
 
531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
531 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
531 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 
519 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  46.91 
 
 
516 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
518 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  45.98 
 
 
523 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
520 aa  359  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  44.05 
 
 
517 aa  357  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  52 
 
 
515 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  32 
 
 
487 aa  127  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  30.03 
 
 
510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  26.93 
 
 
463 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  27.17 
 
 
475 aa  118  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  27.17 
 
 
475 aa  118  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  28.98 
 
 
496 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  28.98 
 
 
496 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  28.38 
 
 
529 aa  118  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  28.98 
 
 
496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  32.2 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  28.98 
 
 
496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  27.33 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3707  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.41 
 
 
1002 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1979  aldehyde dehydrogenase  30.25 
 
 
499 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  28.28 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  31.46 
 
 
477 aa  114  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5206  2-aminomuconic 6-semialdehyde dehydrogenase  29.22 
 
 
487 aa  114  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.532716  normal  0.251126 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 
478 aa  113  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  31.27 
 
 
486 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5756  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.92 
 
 
497 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969126  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  26.94 
 
 
510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  28.12 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.9 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2462  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.78 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.1149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3634  aldehyde dehydrogenase  31.97 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  26.83 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2507  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.78 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.982399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  32.42 
 
 
486 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  32.42 
 
 
486 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  25 
 
 
479 aa  112  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3946  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.2 
 
 
1003 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0875  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.08 
 
 
483 aa  112  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  31.62 
 
 
486 aa  112  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1249  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.8 
 
 
1080 aa  111  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.907532  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  32.42 
 
 
486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  32.08 
 
 
486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2502  aldehyde dehydrogenase  33.44 
 
 
498 aa  111  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.673466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  28.68 
 
 
476 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0382  aldehyde dehydrogenase  28.63 
 
 
491 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.515832 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1138  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.77 
 
 
1085 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3083  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.67 
 
 
499 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  28.43 
 
 
476 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  29.28 
 
 
512 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  28.33 
 
 
496 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  28.94 
 
 
491 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  24.87 
 
 
496 aa  110  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  28.67 
 
 
496 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5498  aldehyde dehydrogenase  28.24 
 
 
487 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
481 aa  110  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>