More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1979 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1979  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
499 aa  1006    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3526  putative aldehyde dehydrogenase  50.83 
 
 
511 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0382  aldehyde dehydrogenase  53.17 
 
 
491 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.515832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
483 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3634  aldehyde dehydrogenase  50.53 
 
 
480 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.95 
 
 
490 aa  425  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  47.92 
 
 
488 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  48.87 
 
 
477 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1545  aldehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04627  aldehyde dehydrogenase  48.76 
 
 
489 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7278  aldehyde dehydrogenase  46.76 
 
 
486 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524049  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3198  aldehyde dehydrogenase  45.32 
 
 
498 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00644996  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7485  aldehyde dehydrogenase  46.84 
 
 
492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1000  aldehyde dehydrogenase  47.1 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1826  aldehyde dehydrogenase  44.74 
 
 
486 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2801  aldehyde dehydrogenase  49.69 
 
 
489 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000306882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7969  Betaine-aldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1170  aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
488 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.77 
 
 
492 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2968  aldehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
482 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.43 
 
 
491 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3377  aldehyde dehydrogenase  47.6 
 
 
482 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
491 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3791  aldehyde dehydrogenase  47.63 
 
 
493 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0604454  normal  0.0877723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3731  aldehyde dehydrogenase  47.9 
 
 
493 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
491 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3718  aldehyde dehydrogenase  47.63 
 
 
495 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
491 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.19 
 
 
498 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 
496 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.15 
 
 
498 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6855  aldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
493 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0177667  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
487 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  43.11 
 
 
494 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  43.11 
 
 
494 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  43.11 
 
 
494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  43.11 
 
 
494 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.11 
 
 
494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  43.91 
 
 
473 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
494 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.03 
 
 
494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.83 
 
 
494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 
493 aa  362  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
494 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.89 
 
 
496 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  45.68 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2715  aldehyde dehydrogenase  47.13 
 
 
485 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 
490 aa  356  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
476 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.09 
 
 
517 aa  353  5e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.522352  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  41.9 
 
 
497 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  41.62 
 
 
494 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 
491 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  45.57 
 
 
476 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.63 
 
 
496 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
475 aa  347  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1420  Aldehyde Dehydrogenase  45.36 
 
 
499 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.98 
 
 
494 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  42.71 
 
 
481 aa  347  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
475 aa  347  4e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
475 aa  347  4e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.78 
 
 
494 aa  347  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4389  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 
482 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
481 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4456  aldehyde dehydrogenase  45.01 
 
 
475 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
474 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
494 aa  342  8e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
494 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2603  aldehyde dehydrogenase  44.05 
 
 
532 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  41.61 
 
 
510 aa  342  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
493 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  45.15 
 
 
478 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  43.86 
 
 
472 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.78 
 
 
494 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  45.15 
 
 
478 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  45.15 
 
 
478 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5858  aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
474 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0748078  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
477 aa  340  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1505  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
478 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
474 aa  339  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  38.73 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  38.73 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.52 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  38.37 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  38.73 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  44.33 
 
 
478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.17 
 
 
503 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  39.34 
 
 
502 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2317  aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 
478 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
468 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2184  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.65 
 
 
478 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.2 
 
 
494 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4862  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.17 
 
 
498 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
478 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3509  aldehyde dehydrogenase  41.95 
 
 
477 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
473 aa  335  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2129  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.44 
 
 
478 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
477 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6096  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
474 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331062  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1063  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
478 aa  333  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>