More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0382 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0382  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
491 aa  999    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.515832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3526  putative aldehyde dehydrogenase  50.82 
 
 
511 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1979  aldehyde dehydrogenase  53.17 
 
 
499 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  53.15 
 
 
488 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3198  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
498 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00644996  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  50.52 
 
 
483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  52 
 
 
477 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04627  aldehyde dehydrogenase  50.93 
 
 
489 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1000  aldehyde dehydrogenase  48.67 
 
 
494 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7278  aldehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524049  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1826  aldehyde dehydrogenase  46.8 
 
 
486 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.43 
 
 
490 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2801  aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 
489 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000306882  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1545  aldehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
484 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7969  Betaine-aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
477 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3634  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
480 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3731  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
493 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7485  aldehyde dehydrogenase  46.71 
 
 
492 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1170  aldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
488 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3791  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
493 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0604454  normal  0.0877723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3718  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
495 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6855  aldehyde dehydrogenase  48.97 
 
 
493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0177667  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 
492 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2968  aldehyde dehydrogenase  48.33 
 
 
482 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3377  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
482 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1420  Aldehyde Dehydrogenase  50.64 
 
 
499 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  45.68 
 
 
491 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
491 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
491 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
491 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 
498 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2715  aldehyde dehydrogenase  47.38 
 
 
485 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
477 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
517 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.522352  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
487 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4389  aldehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
482 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 
487 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
474 aa  349  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 
493 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.92 
 
 
498 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  42.46 
 
 
470 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 
496 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  44.65 
 
 
478 aa  342  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  42.8 
 
 
472 aa  342  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
478 aa  342  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 
476 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0333  aldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 
485 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2129  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.88 
 
 
478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
470 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0352  aldehyde dehydrogenase  42.27 
 
 
499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.585255 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2317  aldehyde dehydrogenase  44.67 
 
 
478 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2184  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.67 
 
 
478 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5222  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.01 
 
 
494 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  43.48 
 
 
485 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
493 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  43.48 
 
 
485 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2352  aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 
474 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.448726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0387  aldehyde dehydrogenase family protein  41.16 
 
 
473 aa  337  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1793  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
478 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1306  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
478 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
485 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0102  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
478 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773929  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1063  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
478 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2001  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
506 aa  336  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.88 
 
 
512 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  39.88 
 
 
497 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
493 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
498 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
478 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7342  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
498 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524049  normal  0.607968 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2271  aldehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
497 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
478 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
478 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 
473 aa  332  7.000000000000001e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  39.11 
 
 
496 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2603  aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
532 aa  332  8e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  40.17 
 
 
481 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
478 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  41.86 
 
 
468 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
502 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
491 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  39.17 
 
 
502 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
475 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
474 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
478 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
476 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  43.37 
 
 
475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  38.32 
 
 
491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.41 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.41 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  43.67 
 
 
478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
494 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 
473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>