More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1000 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1000  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 494 aa  982    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3526  putative aldehyde dehydrogenase  54.6 
 
 		 511 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7278  aldehyde dehydrogenase  51.8 
 
 		 486 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1826  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1545  aldehyde dehydrogenase  47.79 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162133 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7485  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 492 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2801  aldehyde dehydrogenase  49.69 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000306882  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3198  aldehyde dehydrogenase  44.01 
 
 		 498 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00644996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0382  aldehyde dehydrogenase  48.67 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.515832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1979  aldehyde dehydrogenase  47.1 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 		 488 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7969  Betaine-aldehyde dehydrogenase  46.92 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 517 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.522352  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3634  aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.07 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1170  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04627  aldehyde dehydrogenase  43.86 
 
 		 489 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3377  aldehyde dehydrogenase  45.28 
 
 		 482 aa  359  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.95 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5222  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 		 494 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2968  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 482 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 492 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 		 491 aa  346  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6855  aldehyde dehydrogenase  43.46 
 
 		 493 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0177667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3731  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 		 493 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3718  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3791  aldehyde dehydrogenase  43.86 
 
 		 493 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0604454  normal  0.0877723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2715  aldehyde dehydrogenase  45.22 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.37 
 
 		 490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  39.32 
 
 		 491 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  39.32 
 
 		 491 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  39.32 
 
 		 491 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 		 512 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  42.19 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 494 aa  332  7.000000000000001e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  39.5 
 
 		 490 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  39.92 
 
 		 510 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1420  Aldehyde Dehydrogenase  49.18 
 
 		 499 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1970  aldehyde dehydrogenase  38.6 
 
 		 494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0798984  normal  0.254214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.23 
 
 		 490 aa  326  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 		 485 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 		 485 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  41.46 
 
 		 485 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 		 487 aa  323  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  37.88 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7342  aldehyde dehydrogenase  40.95 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524049  normal  0.607968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  41.35 
 
 		 493 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 		 504 aa  316  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2603  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 		 532 aa  316  8e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5389  aldehyde dehydrogenase  41.24 
 
 		 493 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  41.42 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  38.28 
 
 		 492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.14 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  39.67 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  39.83 
 
 		 472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  39.26 
 
 		 513 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 492 aa  312  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.58 
 
 		 491 aa  312  9e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  37.47 
 
 		 502 aa  312  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 472 aa  312  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  37.32 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 478 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.04 
 
 		 496 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  40.46 
 
 		 484 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  40.13 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.08 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.41 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  37.32 
 
 		 494 aa  310  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 		 496 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 		 494 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  37.11 
 
 		 494 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.46 
 
 		 508 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4389  aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 		 482 aa  309  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  36.25 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2352  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.448726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 		 493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  39.26 
 
 		 510 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.13 
 
 		 496 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0902  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.76 
 
 		 491 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.864011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5721  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.32 
 
 		 474 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 482 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>