More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5721 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5721  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
471 aa  967    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7193  Aldehyde Dehydrogenase  63.4 
 
 
473 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3706  aldehyde dehydrogenase  61.91 
 
 
473 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0675814  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1898  aldehyde dehydrogenase  57.96 
 
 
471 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1903  aldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
476 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2087  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.43 
 
 
560 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2261  aldehyde dehydrogenase  52.55 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6271  Aldehyde Dehydrogenase  52.67 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  48.29 
 
 
475 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3700  aldehyde dehydrogenase  47.25 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3249  aldehyde dehydrogenase  45.57 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  46.6 
 
 
473 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  47 
 
 
492 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3193  aldehyde dehydrogenase  45.79 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6310  Aldehyde Dehydrogenase  43.1 
 
 
474 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  45.42 
 
 
485 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  45.42 
 
 
485 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4341  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
479 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  46.68 
 
 
475 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  44.85 
 
 
478 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2215  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
476 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.21786  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 
478 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 
478 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4669  aldehyde dehydrogenase family protein  42.37 
 
 
472 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  45.94 
 
 
484 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2445  Aldehyde Dehydrogenase  45.36 
 
 
476 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3509  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
477 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  42.74 
 
 
485 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 
475 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 
475 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  46.12 
 
 
477 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  43.99 
 
 
477 aa  382  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1859  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
475 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.640053  normal  0.867861 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6363  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.87 
 
 
489 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234314  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1797  aldehyde dehydrogenase  44.23 
 
 
474 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6066  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 
489 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  44.99 
 
 
472 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7546  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
474 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0041  aldehyde dehydrogenase  43.83 
 
 
469 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.267288  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3559  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 
475 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2831  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
476 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0975  putative aldehyde dehydrogenase  44.71 
 
 
476 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4953  aldehyde dehydrogenase  43.59 
 
 
474 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 
474 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  44.07 
 
 
478 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4997  Aldehyde Dehydrogenase  42.49 
 
 
474 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201022  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5730  aldehyde dehydrogenase  43.59 
 
 
479 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6094  aldehyde dehydrogenase  43.59 
 
 
479 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
475 aa  366  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  44.07 
 
 
478 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 
476 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3858  aldehyde dehydrogenase  46.28 
 
 
473 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.683234  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  43.16 
 
 
481 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5977  Aldehyde Dehydrogenase  44.7 
 
 
475 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
481 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  43.62 
 
 
473 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0333  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
485 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3198  aldehyde dehydrogenase  44.26 
 
 
498 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00644996  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5796  aldehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
476 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437703  normal  0.0807135 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6096  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 
474 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331062  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1517  Aldehyde Dehydrogenase  44 
 
 
478 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530205  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6840  aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 
484 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706378  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6577  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
479 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0117224  normal  0.0233893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4159  aldehyde dehydrogenase  47.46 
 
 
473 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.092156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4750  aldehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
482 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1599  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.89 
 
 
474 aa  361  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
476 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 
474 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5017  NAD+-dependent betaine aldehyde dehydrogenase  47.56 
 
 
473 aa  358  9e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  0.466444 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5858  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0748078  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2317  aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 
478 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2184  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.49 
 
 
478 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6014  aldehyde dehydrogenase  43.59 
 
 
474 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2129  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.49 
 
 
478 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 
478 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 
478 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  42.25 
 
 
488 aa  356  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4166  aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 
473 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3644  aldehyde dehydrogenase family protein  44 
 
 
491 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0102  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
478 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773929  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0673  aldehyde dehydrogenase family protein  43.78 
 
 
452 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.31 
 
 
498 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1306  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
478 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1793  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
478 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1063  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
478 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  41.74 
 
 
486 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 
502 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
468 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.7 
 
 
477 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 
478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
478 aa  353  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
490 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
478 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1618  aldehyde dehydrogenase  45.49 
 
 
475 aa  352  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.31 
 
 
496 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2718  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
473 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1651  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  44.66 
 
 
493 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.19 
 
 
491 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>