More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1898 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1903  aldehyde dehydrogenase  83.19 
 
 		 476 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7193  Aldehyde Dehydrogenase  66.81 
 
 		 473 aa  634    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1898  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 471 aa  966    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3706  aldehyde dehydrogenase  66.38 
 
 		 473 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0675814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5721  aldehyde dehydrogenase  57.96 
 
 		 471 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6271  Aldehyde Dehydrogenase  53.09 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2087  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.21 
 
 		 560 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2261  aldehyde dehydrogenase  51.49 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6310  Aldehyde Dehydrogenase  43.95 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 475 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 475 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  45.96 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  41.28 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  43.67 
 
 		 481 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3249  aldehyde dehydrogenase  43.44 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  45.01 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3700  aldehyde dehydrogenase  45.67 
 
 		 484 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0041  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  44.68 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  44.68 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  43.95 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  44.59 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 		 477 aa  382  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3193  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3509  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0975  putative aldehyde dehydrogenase  46.92 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  44.16 
 
 		 478 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  44.16 
 
 		 478 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  43.28 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2215  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.21786  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5730  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 		 479 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6094  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 		 479 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4669  aldehyde dehydrogenase family protein  41.19 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.26 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  45.96 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5796  aldehyde dehydrogenase  46.82 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437703  normal  0.0807135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0333  aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6096  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.23 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6577  aldehyde dehydrogenase  43.8 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0117224  normal  0.0233893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3559  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1859  aldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.640053  normal  0.867861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3644  aldehyde dehydrogenase family protein  46.24 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1797  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  43.99 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7546  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5299  Aldehyde Dehydrogenase  44.8 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  43.35 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0673  aldehyde dehydrogenase family protein  44.1 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3402  aldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.700065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2445  Aldehyde Dehydrogenase  43.44 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.26 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4953  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6014  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4997  Aldehyde Dehydrogenase  43.52 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1517  Aldehyde Dehydrogenase  44 
 
 		 478 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  45.74 
 
 		 476 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6066  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 489 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4750  aldehyde dehydrogenase  46.11 
 
 		 482 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4341  aldehyde dehydrogenase  42.46 
 
 		 479 aa  362  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4159  aldehyde dehydrogenase  45.76 
 
 		 473 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.092156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  42.13 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5858  aldehyde dehydrogenase  43.59 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0748078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  44.04 
 
 		 478 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2317  aldehyde dehydrogenase  45.32 
 
 		 478 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2184  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.32 
 
 		 478 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  43.25 
 
 		 468 aa  359  5e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1505  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 		 478 aa  359  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296285 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6363  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.62 
 
 		 489 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5977  Aldehyde Dehydrogenase  44.68 
 
 		 475 aa  358  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1651  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  46.27 
 
 		 493 aa  358  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7969  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1306  aldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1793  aldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113865  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0102  aldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1063  aldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3253  aldehyde dehydrogenase  46.48 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.877405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4166  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 		 473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 		 483 aa  356  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2129  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.11 
 
 		 478 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3858  aldehyde dehydrogenase  46.5 
 
 		 473 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.683234  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  44.89 
 
 		 478 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  44.89 
 
 		 478 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2271  aldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 		 497 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  44.89 
 
 		 478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4456  aldehyde dehydrogenase  41.38 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  42.5 
 
 		 488 aa  353  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3699  aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 		 471 aa  352  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 477 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2831  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 		 476 aa  349  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3260  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 		 470 aa  349  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0290153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2599  aldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 		 472 aa  349  7e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.423682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1599  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.53 
 
 		 474 aa  348  9e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>