More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3858 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3858  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
473 aa  951    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.683234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2718  betaine-aldehyde dehydrogenase  72.88 
 
 
473 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4159  aldehyde dehydrogenase  71.04 
 
 
473 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.092156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4750  aldehyde dehydrogenase  68.07 
 
 
482 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110894  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5017  NAD+-dependent betaine aldehyde dehydrogenase  67.86 
 
 
473 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  0.466444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  59.15 
 
 
478 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  59.36 
 
 
478 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  59.24 
 
 
477 aa  565  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  59.15 
 
 
478 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3509  aldehyde dehydrogenase  58.81 
 
 
477 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  57.54 
 
 
474 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1797  aldehyde dehydrogenase  58.3 
 
 
474 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3249  aldehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
476 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4953  aldehyde dehydrogenase  57.66 
 
 
474 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4341  aldehyde dehydrogenase  58.17 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1859  aldehyde dehydrogenase  57.32 
 
 
475 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.640053  normal  0.867861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  57.73 
 
 
475 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  57.96 
 
 
492 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  56.65 
 
 
475 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2215  aldehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
476 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.21786  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  55.86 
 
 
481 aa  528  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3193  aldehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
476 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4669  aldehyde dehydrogenase family protein  52.54 
 
 
472 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0333  aldehyde dehydrogenase  59.19 
 
 
485 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0975  putative aldehyde dehydrogenase  58.03 
 
 
476 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  54.99 
 
 
481 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7546  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.36 
 
 
474 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4997  Aldehyde Dehydrogenase  56.05 
 
 
474 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201022  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6577  aldehyde dehydrogenase  56.78 
 
 
479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0117224  normal  0.0233893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2445  Aldehyde Dehydrogenase  55.89 
 
 
476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5299  Aldehyde Dehydrogenase  57.54 
 
 
474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6096  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.63 
 
 
474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331062  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3700  aldehyde dehydrogenase  56.48 
 
 
484 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5858  aldehyde dehydrogenase  57.84 
 
 
474 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0748078  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  55.56 
 
 
485 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  55.13 
 
 
485 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6014  aldehyde dehydrogenase  56.78 
 
 
474 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3559  aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 
475 aa  505  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  55.13 
 
 
485 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0673  aldehyde dehydrogenase family protein  55.65 
 
 
452 aa  504  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  53.83 
 
 
477 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5796  aldehyde dehydrogenase  57.32 
 
 
476 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437703  normal  0.0807135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  54.06 
 
 
485 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5730  aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 
479 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6094  aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 
479 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  55.13 
 
 
484 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2831  aldehyde dehydrogenase  56.53 
 
 
476 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1517  Aldehyde Dehydrogenase  54.22 
 
 
478 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530205  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1599  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  53.72 
 
 
474 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275253  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6363  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.77 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234314  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6066  aldehyde dehydrogenase  55.34 
 
 
489 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3644  aldehyde dehydrogenase family protein  55.96 
 
 
491 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  52.02 
 
 
473 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6310  Aldehyde Dehydrogenase  51.17 
 
 
474 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1618  aldehyde dehydrogenase  57.84 
 
 
475 aa  482  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3253  aldehyde dehydrogenase  55.63 
 
 
478 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.877405  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 
473 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3402  aldehyde dehydrogenase  56.22 
 
 
486 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.700065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4025  aldehyde dehydrogenase  52.62 
 
 
477 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3699  aldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 
471 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  51.8 
 
 
486 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4653  aldehyde dehydrogenase  52.33 
 
 
473 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516666  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2805  aldehyde dehydrogenase  55.13 
 
 
490 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259782  normal  0.872987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1651  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  55.77 
 
 
493 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4166  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
473 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
478 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  54.62 
 
 
474 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0154  aldehyde dehydrogenase  53.94 
 
 
477 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  52.64 
 
 
478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2599  aldehyde dehydrogenase  54.14 
 
 
472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.423682  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0074  aldehyde dehydrogenase  51.49 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68258  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  53.07 
 
 
476 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2372  aldehyde dehydrogenase (NAD-dependent)  53.83 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2129  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  52.43 
 
 
478 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0289  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.75 
 
 
476 aa  442  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2184  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  52.22 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2317  aldehyde dehydrogenase  52.22 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
474 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
475 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1063  aldehyde dehydrogenase  52.01 
 
 
478 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1306  aldehyde dehydrogenase  52.01 
 
 
478 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0102  aldehyde dehydrogenase  52.01 
 
 
478 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
478 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
478 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
475 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
502 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2755  aldehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
483 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1793  aldehyde dehydrogenase  52.01 
 
 
478 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113865  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
478 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
470 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
470 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2910  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
486 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
475 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0041  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
469 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.267288  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
478 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  53.15 
 
 
473 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
478 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1505  aldehyde dehydrogenase  52.01 
 
 
478 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
472 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>