More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4653 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4653  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
473 aa  967    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516666  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4669  aldehyde dehydrogenase family protein  55.98 
 
 
472 aa  558  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  57.57 
 
 
481 aa  555  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  55.16 
 
 
481 aa  543  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  57.63 
 
 
477 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3509  aldehyde dehydrogenase  56.17 
 
 
477 aa  539  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  54.47 
 
 
477 aa  527  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0673  aldehyde dehydrogenase family protein  56 
 
 
452 aa  522  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  57.17 
 
 
475 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1859  aldehyde dehydrogenase  54.8 
 
 
475 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.640053  normal  0.867861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3193  aldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3249  aldehyde dehydrogenase  53.83 
 
 
476 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0333  aldehyde dehydrogenase  56.53 
 
 
485 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5299  Aldehyde Dehydrogenase  56.29 
 
 
474 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4997  Aldehyde Dehydrogenase  54.33 
 
 
474 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201022  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4341  aldehyde dehydrogenase  54.01 
 
 
479 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  54.64 
 
 
475 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  52.77 
 
 
478 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 
492 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
478 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1517  Aldehyde Dehydrogenase  54.99 
 
 
478 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530205  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
478 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3559  aldehyde dehydrogenase  52.77 
 
 
475 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7546  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.34 
 
 
474 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  53.62 
 
 
474 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6014  aldehyde dehydrogenase  55.77 
 
 
474 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2445  Aldehyde Dehydrogenase  54.26 
 
 
476 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2215  aldehyde dehydrogenase  54.26 
 
 
476 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.21786  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4025  aldehyde dehydrogenase  54.81 
 
 
477 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5730  aldehyde dehydrogenase  54.7 
 
 
479 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6094  aldehyde dehydrogenase  54.7 
 
 
479 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5796  aldehyde dehydrogenase  55.27 
 
 
476 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437703  normal  0.0807135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0975  putative aldehyde dehydrogenase  53.8 
 
 
476 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1797  aldehyde dehydrogenase  54.04 
 
 
474 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6096  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.13 
 
 
474 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331062  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5858  aldehyde dehydrogenase  55.34 
 
 
474 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0748078  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0289  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  50.11 
 
 
476 aa  488  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4953  aldehyde dehydrogenase  53.98 
 
 
474 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6577  aldehyde dehydrogenase  54.27 
 
 
479 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0117224  normal  0.0233893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1618  aldehyde dehydrogenase  56.2 
 
 
475 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2831  aldehyde dehydrogenase  54.26 
 
 
476 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3644  aldehyde dehydrogenase family protein  54.7 
 
 
491 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
473 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4750  aldehyde dehydrogenase  54.74 
 
 
482 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4166  aldehyde dehydrogenase  51.07 
 
 
473 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2599  aldehyde dehydrogenase  52.45 
 
 
472 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.423682  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0074  aldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
480 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68258  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  51.61 
 
 
484 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6310  Aldehyde Dehydrogenase  48.09 
 
 
474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3253  aldehyde dehydrogenase  52.53 
 
 
478 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.877405  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3402  aldehyde dehydrogenase  53.09 
 
 
486 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.700065 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
486 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1599  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.21 
 
 
474 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3699  aldehyde dehydrogenase  54.24 
 
 
471 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2755  aldehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
483 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2910  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  49.03 
 
 
485 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2372  aldehyde dehydrogenase (NAD-dependent)  53.21 
 
 
472 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  48.82 
 
 
485 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  49.03 
 
 
485 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  49.03 
 
 
485 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  47.45 
 
 
473 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8188  aldehyde dehydrogenase  48.93 
 
 
517 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.738574  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  50.97 
 
 
474 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0154  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2718  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.33 
 
 
473 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5017  NAD+-dependent betaine aldehyde dehydrogenase  52.12 
 
 
473 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  0.466444 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3700  aldehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
484 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6363  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
489 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234314  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6066  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
489 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6840  aldehyde dehydrogenase  46.92 
 
 
484 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706378  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3858  aldehyde dehydrogenase  52.33 
 
 
473 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.683234  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1032  aldehyde dehydrogenase  53.42 
 
 
472 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.619093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
468 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  44.89 
 
 
475 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  44.89 
 
 
475 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0041  aldehyde dehydrogenase  48.43 
 
 
469 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.267288  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1507  aldehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
486 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  48.83 
 
 
472 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0157  aldehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
486 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2805  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
490 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259782  normal  0.872987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  43.62 
 
 
475 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  50.32 
 
 
473 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.71 
 
 
476 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1651  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.54 
 
 
493 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4159  aldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
473 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.092156  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5977  Aldehyde Dehydrogenase  48.93 
 
 
475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
470 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  47.56 
 
 
476 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.44 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.65 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7323  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.19 
 
 
469 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  47.44 
 
 
478 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
470 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  47.22 
 
 
478 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  46.5 
 
 
478 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  46.5 
 
 
478 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0387  aldehyde dehydrogenase family protein  45.24 
 
 
473 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1338  Aldehyde Dehydrogenase  47.57 
 
 
478 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  47.22 
 
 
478 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>