More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2755 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0157  aldehyde dehydrogenase  71.67 
 
 
486 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1507  aldehyde dehydrogenase  71.67 
 
 
486 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2910  aldehyde dehydrogenase  70.83 
 
 
486 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2755  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
483 aa  984    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0074  aldehyde dehydrogenase  69.17 
 
 
480 aa  663    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68258  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0289  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  62.82 
 
 
476 aa  632  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4025  aldehyde dehydrogenase  65.13 
 
 
477 aa  617  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  61.34 
 
 
481 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  61.34 
 
 
481 aa  598  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0673  aldehyde dehydrogenase family protein  62.17 
 
 
452 aa  571  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  56.96 
 
 
477 aa  535  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1859  aldehyde dehydrogenase  55.23 
 
 
475 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.640053  normal  0.867861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4669  aldehyde dehydrogenase family protein  51.58 
 
 
472 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3249  aldehyde dehydrogenase  51.67 
 
 
476 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  52.6 
 
 
492 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8188  aldehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
517 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.738574  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
474 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  53.04 
 
 
475 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0333  aldehyde dehydrogenase  55.83 
 
 
485 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  52.2 
 
 
475 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7546  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.77 
 
 
474 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3193  aldehyde dehydrogenase  53.14 
 
 
476 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1517  Aldehyde Dehydrogenase  54.93 
 
 
478 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530205  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0975  putative aldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 
476 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2445  Aldehyde Dehydrogenase  52.3 
 
 
476 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3559  aldehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
475 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
478 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2215  aldehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
476 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.21786  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  52.72 
 
 
478 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
478 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1618  aldehyde dehydrogenase  53.65 
 
 
475 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6096  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.32 
 
 
474 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331062  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6577  aldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
479 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0117224  normal  0.0233893 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5858  aldehyde dehydrogenase  52.32 
 
 
474 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0748078  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4997  Aldehyde Dehydrogenase  51.91 
 
 
474 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201022  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3509  aldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
477 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6014  aldehyde dehydrogenase  52.32 
 
 
474 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5796  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
476 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437703  normal  0.0807135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  49.48 
 
 
477 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4653  aldehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
473 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516666  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5299  Aldehyde Dehydrogenase  52.94 
 
 
474 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5730  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
479 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6094  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
479 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4953  aldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
474 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1797  aldehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  52.1 
 
 
474 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2831  aldehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
476 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4341  aldehyde dehydrogenase  49.06 
 
 
479 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4750  aldehyde dehydrogenase  49.48 
 
 
482 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0154  aldehyde dehydrogenase  50.52 
 
 
477 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4166  aldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
473 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
473 aa  422  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6310  Aldehyde Dehydrogenase  44.8 
 
 
474 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.39 
 
 
476 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3253  aldehyde dehydrogenase  48.01 
 
 
478 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.877405  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  49.15 
 
 
473 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2599  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
472 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.423682  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  44.28 
 
 
485 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  47.89 
 
 
478 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3858  aldehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
473 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.683234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1599  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  48.2 
 
 
474 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275253  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
485 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
473 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  46.56 
 
 
486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  46.79 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3699  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
471 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3700  aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6066  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
489 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2372  aldehyde dehydrogenase (NAD-dependent)  49.68 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.12 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2718  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
473 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6363  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234314  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6840  aldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 
484 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706378  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  45.55 
 
 
484 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.55 
 
 
502 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 
475 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  44.82 
 
 
468 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  47.33 
 
 
478 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
475 aa  395  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5017  NAD+-dependent betaine aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
473 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  0.466444 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  47.33 
 
 
478 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
475 aa  395  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  47.33 
 
 
478 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  47.33 
 
 
478 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  46.84 
 
 
476 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2184  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.27 
 
 
478 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4159  aldehyde dehydrogenase  48.51 
 
 
473 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.092156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2317  aldehyde dehydrogenase  46.27 
 
 
478 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  47.33 
 
 
478 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1403  Aldehyde Dehydrogenase  47.47 
 
 
478 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1793  aldehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
478 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113865  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0102  aldehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
478 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1306  aldehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
478 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1032  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
472 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.619093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  45.15 
 
 
472 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2129  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.06 
 
 
478 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1063  aldehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
478 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2271  aldehyde dehydrogenase  47.55 
 
 
497 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>