More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0074 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1507  aldehyde dehydrogenase  70.42 
 
 		 486 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4025  aldehyde dehydrogenase  67.02 
 
 		 477 aa  652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0157  aldehyde dehydrogenase  70.21 
 
 		 486 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0074  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 480 aa  987    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2910  aldehyde dehydrogenase  69.58 
 
 		 486 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2755  aldehyde dehydrogenase  69.17 
 
 		 483 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  60.71 
 
 		 481 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  61.6 
 
 		 481 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0289  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  58.19 
 
 		 476 aa  592  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0673  aldehyde dehydrogenase family protein  62.17 
 
 		 452 aa  588  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  56.85 
 
 		 477 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1859  aldehyde dehydrogenase  59.12 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.640053  normal  0.867861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4669  aldehyde dehydrogenase family protein  52.64 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  55.56 
 
 		 475 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  54.93 
 
 		 492 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8188  aldehyde dehydrogenase  52.73 
 
 		 517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.738574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3249  aldehyde dehydrogenase  53.46 
 
 		 476 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3193  aldehyde dehydrogenase  54.72 
 
 		 476 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  54.3 
 
 		 475 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1618  aldehyde dehydrogenase  56.28 
 
 		 475 aa  501  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0975  putative aldehyde dehydrogenase  52.29 
 
 		 476 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2445  Aldehyde Dehydrogenase  54.51 
 
 		 476 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0333  aldehyde dehydrogenase  55.74 
 
 		 485 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2215  aldehyde dehydrogenase  53.67 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.21786  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5796  aldehyde dehydrogenase  52.83 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437703  normal  0.0807135 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  50.53 
 
 		 474 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4997  Aldehyde Dehydrogenase  50.64 
 
 		 474 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  52.39 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  52.6 
 
 		 478 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  52.6 
 
 		 478 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1517  Aldehyde Dehydrogenase  51.98 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2831  aldehyde dehydrogenase  52.83 
 
 		 476 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  50.83 
 
 		 477 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5299  Aldehyde Dehydrogenase  52.73 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7546  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.15 
 
 		 474 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3509  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3559  aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 475 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4653  aldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4341  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 479 aa  460  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6096  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.15 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5858  aldehyde dehydrogenase  51.15 
 
 		 474 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0748078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6577  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 		 479 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0117224  normal  0.0233893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4953  aldehyde dehydrogenase  52.19 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  48.64 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  52.31 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1797  aldehyde dehydrogenase  52.29 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5730  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 479 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3253  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.877405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6094  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 479 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4166  aldehyde dehydrogenase  49.16 
 
 		 473 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5017  NAD+-dependent betaine aldehyde dehydrogenase  52.77 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  0.466444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0154  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6014  aldehyde dehydrogenase  49.48 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  48.09 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  48.94 
 
 		 485 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  48.94 
 
 		 485 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  48.93 
 
 		 473 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 478 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  48.94 
 
 		 485 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3699  aldehyde dehydrogenase  51.57 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4750  aldehyde dehydrogenase  49.48 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2599  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 472 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.423682  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2718  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.17 
 
 		 473 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6066  aldehyde dehydrogenase  47.88 
 
 		 489 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4159  aldehyde dehydrogenase  51.28 
 
 		 473 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.092156  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3700  aldehyde dehydrogenase  47.58 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  48.41 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 		 476 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3858  aldehyde dehydrogenase  51.49 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.683234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2372  aldehyde dehydrogenase (NAD-dependent)  52.13 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 		 475 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1599  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  48.43 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2805  aldehyde dehydrogenase  49.26 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259782  normal  0.872987 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6363  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 		 489 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  46.17 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  48.83 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.47 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  48.4 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.19 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  48.4 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1651  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  50.11 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  47.13 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  49.37 
 
 		 473 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  47.26 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6310  Aldehyde Dehydrogenase  45.22 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  48.4 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3644  aldehyde dehydrogenase family protein  48.42 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2317  aldehyde dehydrogenase  47.97 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1032  aldehyde dehydrogenase  52.77 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.619093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.9 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2184  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.97 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2129  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.47 
 
 		 478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0102  aldehyde dehydrogenase  47.76 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1793  aldehyde dehydrogenase  47.76 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1306  aldehyde dehydrogenase  47.76 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1063  aldehyde dehydrogenase  47.76 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2271  aldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>