More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4669 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4669  aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 
472 aa  983    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  59.06 
 
 
477 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  56.18 
 
 
481 aa  558  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  55.35 
 
 
481 aa  557  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1859  aldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
475 aa  551  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.640053  normal  0.867861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  55.32 
 
 
478 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  55.32 
 
 
478 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  55.11 
 
 
478 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4653  aldehyde dehydrogenase  55.98 
 
 
473 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516666  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3509  aldehyde dehydrogenase  55.74 
 
 
477 aa  542  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  54.47 
 
 
477 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0673  aldehyde dehydrogenase family protein  56.22 
 
 
452 aa  538  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3249  aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 
476 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  54.06 
 
 
475 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0333  aldehyde dehydrogenase  56.01 
 
 
485 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  51.92 
 
 
475 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  52.67 
 
 
492 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4953  aldehyde dehydrogenase  54.45 
 
 
474 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0975  putative aldehyde dehydrogenase  53.08 
 
 
476 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4341  aldehyde dehydrogenase  53.83 
 
 
479 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4025  aldehyde dehydrogenase  54.74 
 
 
477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1797  aldehyde dehydrogenase  53.7 
 
 
474 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2215  aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 
476 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.21786  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  52.24 
 
 
474 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2445  Aldehyde Dehydrogenase  54.14 
 
 
476 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3193  aldehyde dehydrogenase  52.65 
 
 
476 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0074  aldehyde dehydrogenase  52.53 
 
 
480 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68258  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3559  aldehyde dehydrogenase  52.14 
 
 
475 aa  505  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6577  aldehyde dehydrogenase  52.65 
 
 
479 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0117224  normal  0.0233893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5796  aldehyde dehydrogenase  53.09 
 
 
476 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437703  normal  0.0807135 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7546  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.65 
 
 
474 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6094  aldehyde dehydrogenase  51.8 
 
 
479 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0289  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  50.95 
 
 
476 aa  501  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5730  aldehyde dehydrogenase  51.8 
 
 
479 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1517  Aldehyde Dehydrogenase  52.02 
 
 
478 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530205  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5858  aldehyde dehydrogenase  52.44 
 
 
474 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0748078  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6096  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.44 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331062  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2831  aldehyde dehydrogenase  52.65 
 
 
476 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1618  aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 
475 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1599  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  52.03 
 
 
474 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275253  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5299  Aldehyde Dehydrogenase  51.28 
 
 
474 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6014  aldehyde dehydrogenase  52.02 
 
 
474 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2755  aldehyde dehydrogenase  51.58 
 
 
483 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4997  Aldehyde Dehydrogenase  49.04 
 
 
474 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201022  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8188  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
517 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.738574  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2910  aldehyde dehydrogenase  52.45 
 
 
486 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4166  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
473 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
473 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  48.83 
 
 
485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  48.83 
 
 
485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3700  aldehyde dehydrogenase  48.83 
 
 
484 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4750  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110894  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
485 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  48.39 
 
 
485 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6310  Aldehyde Dehydrogenase  48.4 
 
 
474 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
486 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3858  aldehyde dehydrogenase  52.54 
 
 
473 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.683234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1507  aldehyde dehydrogenase  52.24 
 
 
486 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0157  aldehyde dehydrogenase  52 
 
 
486 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  49.04 
 
 
484 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6363  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
489 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234314  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2599  aldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
472 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.423682  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5017  NAD+-dependent betaine aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
473 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  0.466444 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6066  aldehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
489 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3253  aldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
478 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.877405  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3699  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  46.5 
 
 
475 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2718  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.69 
 
 
473 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  46.5 
 
 
475 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4159  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
473 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.092156  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
474 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  45.01 
 
 
475 aa  434  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2372  aldehyde dehydrogenase (NAD-dependent)  48.62 
 
 
472 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0154  aldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
477 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  46.81 
 
 
468 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3644  aldehyde dehydrogenase family protein  48.6 
 
 
491 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1651  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  48.61 
 
 
493 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2805  aldehyde dehydrogenase  48.2 
 
 
490 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259782  normal  0.872987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3402  aldehyde dehydrogenase  47.73 
 
 
486 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.700065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  45.97 
 
 
478 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1032  aldehyde dehydrogenase  48.83 
 
 
472 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.619093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
476 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.63 
 
 
474 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.37 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  46.17 
 
 
472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6840  aldehyde dehydrogenase  42.04 
 
 
484 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706378  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
470 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5977  Aldehyde Dehydrogenase  46.48 
 
 
475 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  46.27 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.27 
 
 
502 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  46.4 
 
 
473 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
478 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  42.34 
 
 
470 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.67 
 
 
496 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0041  aldehyde dehydrogenase  43.95 
 
 
469 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.267288  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  45.63 
 
 
478 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>