More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1403 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2184  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  72.8 
 
 
478 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  88.87 
 
 
478 aa  840    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  73.01 
 
 
478 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2129  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  73.01 
 
 
478 aa  680    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1306  aldehyde dehydrogenase  72.59 
 
 
478 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0102  aldehyde dehydrogenase  72.59 
 
 
478 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773929  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  83.3 
 
 
476 aa  785    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2317  aldehyde dehydrogenase  72.8 
 
 
478 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1403  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
478 aa  965    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  73.22 
 
 
478 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1338  Aldehyde Dehydrogenase  98.74 
 
 
478 aa  955    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2271  aldehyde dehydrogenase  72.59 
 
 
497 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  69.15 
 
 
496 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  72.73 
 
 
474 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1793  aldehyde dehydrogenase  72.59 
 
 
478 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  82.03 
 
 
476 aa  749    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1505  aldehyde dehydrogenase  70.92 
 
 
478 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  73.22 
 
 
478 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  72.8 
 
 
478 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  72.8 
 
 
478 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  73.22 
 
 
502 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  73.22 
 
 
478 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1063  aldehyde dehydrogenase  72.59 
 
 
478 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  62.5 
 
 
472 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2352  aldehyde dehydrogenase  60.89 
 
 
474 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.448726  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5977  Aldehyde Dehydrogenase  64.14 
 
 
475 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  58.8 
 
 
468 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.91 
 
 
472 aa  519  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7323  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.36 
 
 
469 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  51.69 
 
 
481 aa  487  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  56.48 
 
 
473 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  52.65 
 
 
470 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
481 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4515  aldehyde dehydrogenase  53.08 
 
 
470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0317  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.37 
 
 
472 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.448978 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0673  aldehyde dehydrogenase family protein  52.22 
 
 
452 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
470 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0298  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.37 
 
 
472 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  51.49 
 
 
475 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0307  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.37 
 
 
472 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  50.53 
 
 
492 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
474 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3249  aldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
476 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1859  aldehyde dehydrogenase  51.91 
 
 
475 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.640053  normal  0.867861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7300  Aldehyde Dehydrogenase  53.98 
 
 
476 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.784952  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3193  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
476 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
477 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
478 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  50.53 
 
 
478 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
478 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2878  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
473 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0192493  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3509  aldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  49.68 
 
 
475 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4997  Aldehyde Dehydrogenase  49.57 
 
 
474 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201022  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6310  Aldehyde Dehydrogenase  45.89 
 
 
474 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4341  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
479 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3559  aldehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
475 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2445  Aldehyde Dehydrogenase  49.79 
 
 
476 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2215  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
476 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.21786  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1517  Aldehyde Dehydrogenase  51.16 
 
 
478 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530205  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4456  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
475 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5299  Aldehyde Dehydrogenase  51.7 
 
 
474 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0975  putative aldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 
476 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4526  aldehyde dehydrogenase  52.99 
 
 
495 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1905  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
472 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343927  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4750  aldehyde dehydrogenase  52 
 
 
482 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4166  aldehyde dehydrogenase  47.16 
 
 
473 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
485 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
485 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3700  aldehyde dehydrogenase  51.17 
 
 
484 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
485 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4953  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
474 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0333  aldehyde dehydrogenase  51.17 
 
 
485 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7546  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
474 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  48.28 
 
 
485 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  47.87 
 
 
473 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0387  aldehyde dehydrogenase family protein  47.66 
 
 
473 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4669  aldehyde dehydrogenase family protein  45.63 
 
 
472 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4298  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
485 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.891318  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1797  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
474 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  47.78 
 
 
477 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2599  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
472 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.423682  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6014  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
474 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5730  aldehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
479 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6094  aldehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
479 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5796  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
476 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437703  normal  0.0807135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3644  aldehyde dehydrogenase family protein  51.72 
 
 
491 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  48.32 
 
 
477 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  50.64 
 
 
484 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6577  aldehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
479 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0117224  normal  0.0233893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4025  aldehyde dehydrogenase  47.26 
 
 
477 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2831  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
476 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
490 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6066  aldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
489 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  47.88 
 
 
473 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6840  aldehyde dehydrogenase  45.91 
 
 
484 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706378  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6096  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.29 
 
 
474 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331062  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3211  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
477 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5858  aldehyde dehydrogenase  48.08 
 
 
474 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0748078  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6363  betaine-aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
489 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>