More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3211 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3211  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
477 aa  951    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3260  aldehyde dehydrogenase  60.99 
 
 
470 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0290153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4515  aldehyde dehydrogenase  59.31 
 
 
470 aa  522  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4526  aldehyde dehydrogenase  59.41 
 
 
495 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  50.11 
 
 
478 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
478 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 
476 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  49.25 
 
 
468 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1403  Aldehyde Dehydrogenase  50.76 
 
 
478 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.25 
 
 
474 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1338  Aldehyde Dehydrogenase  50.76 
 
 
478 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7323  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
469 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
502 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.44 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  48.52 
 
 
473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2129  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  49.89 
 
 
478 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2184  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  49.89 
 
 
478 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2317  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
478 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  44.99 
 
 
472 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4456  aldehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
475 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2271  aldehyde dehydrogenase  50.97 
 
 
497 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1063  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1306  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0102  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1793  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113865  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5977  Aldehyde Dehydrogenase  49.24 
 
 
475 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3700  aldehyde dehydrogenase  45.92 
 
 
484 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
478 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
474 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  44.77 
 
 
481 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.71 
 
 
472 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3249  aldehyde dehydrogenase  43.52 
 
 
476 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  44.09 
 
 
485 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3193  aldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 
476 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 
470 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1505  aldehyde dehydrogenase  48.16 
 
 
478 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2352  aldehyde dehydrogenase  46.22 
 
 
474 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.448726  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  44.95 
 
 
484 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0673  aldehyde dehydrogenase family protein  45.39 
 
 
452 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  44.71 
 
 
470 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  44.23 
 
 
481 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6269  aldehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
485 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.192118 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6436  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
485 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6671  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
485 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146251  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1517  Aldehyde Dehydrogenase  44.02 
 
 
478 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530205  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6577  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
475 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325295  normal  0.274323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0298  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
472 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2215  aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
476 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.21786  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6066  aldehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
489 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1859  aldehyde dehydrogenase  43.44 
 
 
475 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.640053  normal  0.867861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0307  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
472 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0317  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
472 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.448978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2445  Aldehyde Dehydrogenase  43.52 
 
 
476 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0333  aldehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
485 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3644  aldehyde dehydrogenase family protein  46.24 
 
 
491 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
477 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  41.94 
 
 
492 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6154  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 
475 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6310  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 
474 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7300  Aldehyde Dehydrogenase  46.47 
 
 
476 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.784952  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4997  Aldehyde Dehydrogenase  43.44 
 
 
474 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201022  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
478 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0387  aldehyde dehydrogenase family protein  41.79 
 
 
473 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
478 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5299  Aldehyde Dehydrogenase  43.64 
 
 
474 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
486 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7546  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
474 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2599  aldehyde dehydrogenase  45.09 
 
 
472 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.423682  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0975  putative aldehyde dehydrogenase  41.94 
 
 
476 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0166  aldehyde dehydrogenase  45.14 
 
 
473 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
478 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5796  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
476 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437703  normal  0.0807135 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6840  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
484 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706378  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2414  aldehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
477 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3402  aldehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
486 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.700065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3559  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
475 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  42 
 
 
473 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6363  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 
489 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234314  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4750  aldehyde dehydrogenase  43.7 
 
 
482 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3509  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
477 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4341  aldehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
479 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2878  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0192493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
492 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4166  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
473 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8188  aldehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
517 aa  356  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.738574  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6094  aldehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
479 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5730  aldehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
479 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2718  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
473 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.98 
 
 
483 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6577  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0117224  normal  0.0233893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.26 
 
 
491 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
475 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
487 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
475 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2831  aldehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
476 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>