More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5310 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 496 aa  1008    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8483  Aldehyde Dehydrogenase  64.52 
 
 		 522 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37507  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2725  aldehyde dehydrogenase  69.98 
 
 		 494 aa  685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1643  aldehyde dehydrogenase  69.33 
 
 		 514 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4799  aldehyde dehydrogenase  68.4 
 
 		 513 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  99.4 
 
 		 496 aa  1002    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0851  aldehyde dehydrogenase family protein  69.29 
 
 		 510 aa  692    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0161  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  65.86 
 
 		 503 aa  638    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221035  normal  0.540885 
 
 
-
 
NC_003296  RS02148  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  68.26 
 
 		 504 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  70.39 
 
 		 494 aa  688    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3784  Aldehyde Dehydrogenase  67.6 
 
 		 512 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.888405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0908  aldehyde dehydrogenase family protein  69.29 
 
 		 510 aa  692    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41608  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3885  aldehyde dehydrogenase  66.87 
 
 		 499 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1891  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  88.51 
 
 		 496 aa  908    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5719  aldehyde dehydrogenase  66.8 
 
 		 511 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3504  aldehyde dehydrogenase  65.35 
 
 		 522 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0779  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  69.87 
 
 		 503 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0381383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  98.39 
 
 		 496 aa  994    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1459  aldehyde dehydrogenase  70.3 
 
 		 510 aa  701    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  89.52 
 
 		 496 aa  918    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5160  aldehyde dehydrogenase  68.62 
 
 		 503 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.447339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2515  aldehyde dehydrogenase  64.19 
 
 		 502 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0495  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  70.08 
 
 		 535 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1297  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  66.33 
 
 		 530 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0550  aldehyde dehydrogenase  80.44 
 
 		 496 aa  821    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.499544  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1249  putative aldehyde dehydrogenase  65.4 
 
 		 517 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.586964  normal  0.195396 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1292  putative aldehyde dehydrogenase  69.98 
 
 		 494 aa  686    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2411  aldehyde dehydrogenase  66.33 
 
 		 516 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0380  aldehyde dehydrogenase  68.2 
 
 		 503 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6596  Aldehyde Dehydrogenase  67.34 
 
 		 499 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173575  normal  0.169745 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0678  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  69.87 
 
 		 535 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.808953  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1201  Aldehyde Dehydrogenase  68.41 
 
 		 508 aa  659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3451  aldehyde dehydrogenase  68.83 
 
 		 503 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0285  aldehyde dehydrogenase  68.41 
 
 		 506 aa  674    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0898  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  70.08 
 
 		 503 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  99.4 
 
 		 496 aa  1002    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0310  Aldehyde Dehydrogenase  64.92 
 
 		 512 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0880  aldehyde dehydrogenase  65.72 
 
 		 510 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3228  aldehyde dehydrogenase  72.23 
 
 		 504 aa  741    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.970783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1631  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  69.87 
 
 		 503 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0566  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  69.87 
 
 		 535 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0787  aldehyde dehydrogenase  66.13 
 
 		 511 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.802258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2578  putative aldehyde dehydrogenase family protein  67.14 
 
 		 499 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2080  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  70.08 
 
 		 535 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1983  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  70.08 
 
 		 535 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467397  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3110  aldehyde dehydrogenase  66 
 
 		 503 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0895  aldehyde dehydrogenase  74.75 
 
 		 496 aa  767    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2655  aldehyde dehydrogenase  69.03 
 
 		 502 aa  686    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1810  aldehyde dehydrogenase  70.33 
 
 		 507 aa  667    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3097  aldehyde dehydrogenase  68.62 
 
 		 503 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4998  aldehyde dehydrogenase  69.04 
 
 		 503 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1270  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  68.35 
 
 		 529 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3627  aldehyde dehydrogenase  68.97 
 
 		 503 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.225192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4113  Aldehyde Dehydrogenase  67.6 
 
 		 512 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4630  aldehyde dehydrogenase  68.41 
 
 		 503 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4356  aldehyde dehydrogenase  80.68 
 
 		 497 aa  825    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51050  aldehyde dehydrogenase  81.69 
 
 		 529 aa  828    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.790236  hitchhiker  0.000000280962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5270  aldehyde dehydrogenase  68.62 
 
 		 571 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.295049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3159  aldehyde dehydrogenase  69.09 
 
 		 510 aa  701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1287  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  68.35 
 
 		 529 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.195154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1935  Aldehyde Dehydrogenase  65.47 
 
 		 515 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0565  aldehyde dehydrogenase  63.64 
 
 		 506 aa  625  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.254181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2375  aldehyde dehydrogenase  65.18 
 
 		 505 aa  626  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1939  Aldehyde Dehydrogenase  66.73 
 
 		 510 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04370  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  64.85 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0694384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3952  aldehyde dehydrogenase  61.6 
 
 		 507 aa  604  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338759  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0239  Aldehyde Dehydrogenase  63.56 
 
 		 509 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3207  aldehyde dehydrogenase  62.27 
 
 		 507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13322  piperideine-6-carboxilic acid dehydrogenase pcd  64.63 
 
 		 494 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3946  Aldehyde Dehydrogenase  60.94 
 
 		 501 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3050  aldehyde dehydrogenase  63.67 
 
 		 505 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2418  Aldehyde Dehydrogenase  61.68 
 
 		 509 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1723  aldehyde dehydrogenase  65.18 
 
 		 507 aa  589  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3186  aldehyde dehydrogenase  65.18 
 
 		 506 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3681  Aldehyde Dehydrogenase  60.63 
 
 		 509 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.160701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02440  probable piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  60.59 
 
 		 517 aa  575  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.145685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5034  Aldehyde Dehydrogenase  60.63 
 
 		 512 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.96279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3069  Aldehyde Dehydrogenase  60.5 
 
 		 508 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00203501  normal  0.959817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0720  aldehyde dehydrogenase  59.21 
 
 		 514 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1225  aldehyde dehydrogenase  57.59 
 
 		 517 aa  562  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0053  NAD+-dependent aldehyde dehydrogenase  56.63 
 
 		 513 aa  541  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1728  Aldehyde Dehydrogenase  59.71 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193131  normal  0.860615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1305  hypothetical protein  53.24 
 
 		 506 aa  524  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1304  hypothetical protein  53.24 
 
 		 506 aa  524  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00811  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  59.03 
 
 		 526 aa  522  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  56.24 
 
 		 513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07130  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+], putative  46.27 
 
 		 581 aa  419  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  40.49 
 
 		 496 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  36.13 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  36.84 
 
 		 493 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  36.7 
 
 		 498 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  36.42 
 
 		 493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  36.19 
 
 		 499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  34.96 
 
 		 493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  39.22 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  37.47 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  36.56 
 
 		 503 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  36.78 
 
 		 497 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  35.32 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>