More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1810 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5160  aldehyde dehydrogenase  67 
 
 
503 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.447339 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4998  aldehyde dehydrogenase  66.8 
 
 
503 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2725  aldehyde dehydrogenase  69.25 
 
 
494 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1201  Aldehyde Dehydrogenase  74.38 
 
 
508 aa  682    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2411  aldehyde dehydrogenase  71.4 
 
 
516 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  70.33 
 
 
496 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3159  aldehyde dehydrogenase  74.1 
 
 
510 aa  750    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510599  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0161  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  67.89 
 
 
503 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221035  normal  0.540885 
 
 
-
 
NC_003296  RS02148  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  66.8 
 
 
504 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3784  Aldehyde Dehydrogenase  70.16 
 
 
512 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.888405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0908  aldehyde dehydrogenase family protein  72.89 
 
 
510 aa  738    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1891  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  67.68 
 
 
496 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1459  aldehyde dehydrogenase  73.49 
 
 
510 aa  740    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0310  Aldehyde Dehydrogenase  71.09 
 
 
512 aa  689    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0779  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  66.8 
 
 
503 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0381383  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0851  aldehyde dehydrogenase family protein  72.89 
 
 
510 aa  737    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  70.33 
 
 
496 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  68.08 
 
 
496 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6596  Aldehyde Dehydrogenase  64.58 
 
 
499 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173575  normal  0.169745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4356  aldehyde dehydrogenase  70.56 
 
 
497 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2515  aldehyde dehydrogenase  69.05 
 
 
502 aa  683    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0787  aldehyde dehydrogenase  72.62 
 
 
511 aa  692    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.802258  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0495  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  66.8 
 
 
535 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0550  aldehyde dehydrogenase  67.47 
 
 
496 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.499544  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1292  putative aldehyde dehydrogenase  69.87 
 
 
494 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0380  aldehyde dehydrogenase  66.4 
 
 
503 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4113  Aldehyde Dehydrogenase  69.57 
 
 
512 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189618  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0285  aldehyde dehydrogenase  67.27 
 
 
506 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0898  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  66.8 
 
 
503 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1631  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  66.8 
 
 
503 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0880  aldehyde dehydrogenase  70.04 
 
 
510 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3228  aldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 
504 aa  684    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.970783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  70.53 
 
 
496 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5719  aldehyde dehydrogenase  70.4 
 
 
511 aa  704    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  69.67 
 
 
494 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  70.33 
 
 
496 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2080  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  66.8 
 
 
535 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2578  putative aldehyde dehydrogenase family protein  64.58 
 
 
499 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8483  Aldehyde Dehydrogenase  68.66 
 
 
522 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3504  aldehyde dehydrogenase  73.12 
 
 
522 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0239  Aldehyde Dehydrogenase  69 
 
 
509 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3110  aldehyde dehydrogenase  70.8 
 
 
503 aa  680    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0895  aldehyde dehydrogenase  65.05 
 
 
496 aa  666    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2655  aldehyde dehydrogenase  66.94 
 
 
502 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1810  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
507 aa  1009    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3097  aldehyde dehydrogenase  66.8 
 
 
503 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1983  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  66.8 
 
 
535 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3627  aldehyde dehydrogenase  72.69 
 
 
503 aa  727    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.225192  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4630  aldehyde dehydrogenase  67 
 
 
503 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0678  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  66.8 
 
 
535 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.808953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0566  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  66.8 
 
 
535 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51050  aldehyde dehydrogenase  70 
 
 
529 aa  683    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.790236  hitchhiker  0.000000280962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5270  aldehyde dehydrogenase  66.87 
 
 
571 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.295049  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3451  aldehyde dehydrogenase  67.6 
 
 
503 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208347  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1249  putative aldehyde dehydrogenase  69.77 
 
 
517 aa  705    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.586964  normal  0.195396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3885  aldehyde dehydrogenase  65.62 
 
 
499 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3186  aldehyde dehydrogenase  75.9 
 
 
506 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2375  aldehyde dehydrogenase  64.73 
 
 
505 aa  613  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1643  aldehyde dehydrogenase  67.58 
 
 
514 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4799  aldehyde dehydrogenase  66.74 
 
 
513 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228606  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04370  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.83 
 
 
502 aa  601  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0694384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1297  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.35 
 
 
530 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0565  aldehyde dehydrogenase  62.5 
 
 
506 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.254181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1270  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.68 
 
 
529 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1287  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.68 
 
 
529 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3952  aldehyde dehydrogenase  61.03 
 
 
507 aa  590  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338759  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1939  Aldehyde Dehydrogenase  66.32 
 
 
510 aa  588  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3946  Aldehyde Dehydrogenase  64.01 
 
 
501 aa  589  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1723  aldehyde dehydrogenase  66.46 
 
 
507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3207  aldehyde dehydrogenase  61.23 
 
 
507 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1935  Aldehyde Dehydrogenase  63.1 
 
 
515 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2418  Aldehyde Dehydrogenase  57.83 
 
 
509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5034  Aldehyde Dehydrogenase  59.79 
 
 
512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.96279  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13322  piperideine-6-carboxilic acid dehydrogenase pcd  64.5 
 
 
494 aa  571  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3681  Aldehyde Dehydrogenase  56.08 
 
 
509 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.160701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3050  aldehyde dehydrogenase  60.52 
 
 
505 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02440  probable piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.88 
 
 
517 aa  555  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.145685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3069  Aldehyde Dehydrogenase  57.98 
 
 
508 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00203501  normal  0.959817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1225  aldehyde dehydrogenase  56.67 
 
 
517 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0720  aldehyde dehydrogenase  57.64 
 
 
514 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1305  hypothetical protein  55.86 
 
 
506 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1304  hypothetical protein  55.86 
 
 
506 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0053  NAD+-dependent aldehyde dehydrogenase  54.93 
 
 
513 aa  538  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1728  Aldehyde Dehydrogenase  57.89 
 
 
510 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193131  normal  0.860615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00811  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  55.96 
 
 
526 aa  524  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 
513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07130  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+], putative  46.22 
 
 
581 aa  409  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  37.79 
 
 
493 aa  291  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  37.63 
 
 
493 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  38.72 
 
 
496 aa  286  8e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  36.84 
 
 
493 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  36.4 
 
 
500 aa  280  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  40.32 
 
 
516 aa  276  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  37.04 
 
 
498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  36.83 
 
 
505 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  38.64 
 
 
498 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  37.59 
 
 
496 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  36.75 
 
 
503 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  38.6 
 
 
498 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  36.32 
 
 
497 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>