More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0880 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2411  aldehyde dehydrogenase  71.09 
 
 		 516 aa  713    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1459  aldehyde dehydrogenase  72.06 
 
 		 510 aa  728    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  65.72 
 
 		 496 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1631  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.41 
 
 		 503 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0161  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  68.88 
 
 		 503 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221035  normal  0.540885 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0908  aldehyde dehydrogenase family protein  71.86 
 
 		 510 aa  730    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  65.92 
 
 		 496 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1983  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.35 
 
 		 535 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3784  Aldehyde Dehydrogenase  68.55 
 
 		 512 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.888405 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0779  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.41 
 
 		 503 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0381383  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3451  aldehyde dehydrogenase  65.81 
 
 		 503 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  69.29 
 
 		 494 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0239  Aldehyde Dehydrogenase  71.71 
 
 		 509 aa  708    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  65.72 
 
 		 496 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2080  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.35 
 
 		 535 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3504  aldehyde dehydrogenase  70.35 
 
 		 522 aa  708    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0787  aldehyde dehydrogenase  81.19 
 
 		 511 aa  816    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.802258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2515  aldehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 502 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0678  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.35 
 
 		 535 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.808953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0495  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.35 
 
 		 535 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  65.72 
 
 		 496 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1292  putative aldehyde dehydrogenase  69.29 
 
 		 494 aa  674    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2375  aldehyde dehydrogenase  66.53 
 
 		 505 aa  660    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0380  aldehyde dehydrogenase  65.01 
 
 		 503 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2725  aldehyde dehydrogenase  69.7 
 
 		 494 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0285  aldehyde dehydrogenase  66.27 
 
 		 506 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0898  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.01 
 
 		 503 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1723  aldehyde dehydrogenase  69.06 
 
 		 507 aa  641    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0851  aldehyde dehydrogenase family protein  71.46 
 
 		 510 aa  725    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4998  aldehyde dehydrogenase  65.01 
 
 		 503 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0880  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 510 aa  1026    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3228  aldehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 504 aa  668    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.970783  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3885  aldehyde dehydrogenase  64.44 
 
 		 499 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2578  putative aldehyde dehydrogenase family protein  63.84 
 
 		 499 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5719  aldehyde dehydrogenase  70.55 
 
 		 511 aa  722    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3159  aldehyde dehydrogenase  71.66 
 
 		 510 aa  731    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6596  Aldehyde Dehydrogenase  63.53 
 
 		 499 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173575  normal  0.169745 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5270  aldehyde dehydrogenase  65.21 
 
 		 571 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.295049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3110  aldehyde dehydrogenase  68.99 
 
 		 503 aa  681    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2655  aldehyde dehydrogenase  64.14 
 
 		 502 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1810  aldehyde dehydrogenase  70.04 
 
 		 507 aa  689    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3186  aldehyde dehydrogenase  71.91 
 
 		 506 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3097  aldehyde dehydrogenase  65.21 
 
 		 503 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0566  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.35 
 
 		 535 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4113  Aldehyde Dehydrogenase  68.95 
 
 		 512 aa  711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1201  Aldehyde Dehydrogenase  69.35 
 
 		 508 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5160  aldehyde dehydrogenase  64.41 
 
 		 503 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.447339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3627  aldehyde dehydrogenase  72.71 
 
 		 503 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.225192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1249  putative aldehyde dehydrogenase  70.84 
 
 		 517 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.586964  normal  0.195396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0310  Aldehyde Dehydrogenase  84.71 
 
 		 512 aa  850    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4630  aldehyde dehydrogenase  64.21 
 
 		 503 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8483  Aldehyde Dehydrogenase  69.58 
 
 		 522 aa  700    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1891  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  63.91 
 
 		 496 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  63.91 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0550  aldehyde dehydrogenase  63.51 
 
 		 496 aa  631  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.499544  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51050  aldehyde dehydrogenase  65.39 
 
 		 529 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.790236  hitchhiker  0.000000280962 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0895  aldehyde dehydrogenase  61.62 
 
 		 496 aa  627  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02148  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  64.74 
 
 		 504 aa  621  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4356  aldehyde dehydrogenase  63.98 
 
 		 497 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3952  aldehyde dehydrogenase  62.45 
 
 		 507 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338759  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1643  aldehyde dehydrogenase  63.17 
 
 		 514 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4799  aldehyde dehydrogenase  62.7 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0565  aldehyde dehydrogenase  61.21 
 
 		 506 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.254181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1287  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  64.35 
 
 		 529 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.195154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1270  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  64.35 
 
 		 529 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1297  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  63.62 
 
 		 530 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3207  aldehyde dehydrogenase  63.33 
 
 		 507 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1939  Aldehyde Dehydrogenase  60.95 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1935  Aldehyde Dehydrogenase  58.78 
 
 		 515 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0720  aldehyde dehydrogenase  58.54 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04370  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  59 
 
 		 502 aa  565  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0694384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3050  aldehyde dehydrogenase  60.24 
 
 		 505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2418  Aldehyde Dehydrogenase  53.89 
 
 		 509 aa  552  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5034  Aldehyde Dehydrogenase  54.69 
 
 		 512 aa  552  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.96279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3946  Aldehyde Dehydrogenase  60.79 
 
 		 501 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3681  Aldehyde Dehydrogenase  57.49 
 
 		 509 aa  549  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.160701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02440  probable piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  53.18 
 
 		 517 aa  545  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.145685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13322  piperideine-6-carboxilic acid dehydrogenase pcd  62.68 
 
 		 494 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3069  Aldehyde Dehydrogenase  57.56 
 
 		 508 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00203501  normal  0.959817 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00811  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.94 
 
 		 526 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1304  hypothetical protein  51.87 
 
 		 506 aa  521  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0053  NAD+-dependent aldehyde dehydrogenase  52.25 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1728  Aldehyde Dehydrogenase  55.74 
 
 		 510 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193131  normal  0.860615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1305  hypothetical protein  51.87 
 
 		 506 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1225  aldehyde dehydrogenase  51.63 
 
 		 517 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  52.83 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07130  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+], putative  43.64 
 
 		 581 aa  398  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450965  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  35.68 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  36.12 
 
 		 496 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  35.06 
 
 		 493 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  38.2 
 
 		 516 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  33.26 
 
 		 493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  33.96 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  32.79 
 
 		 498 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  33.12 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  34.45 
 
 		 503 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  36.03 
 
 		 498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  34.12 
 
 		 497 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2343  Aldehyde Dehydrogenase  33.74 
 
 		 509 aa  236  8e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  33.56 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>