More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5719 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  66.8 
 
 		 496 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0161  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  67.47 
 
 		 503 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221035  normal  0.540885 
 
 
-
 
NC_003296  RS02148  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  67.73 
 
 		 504 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0851  aldehyde dehydrogenase family protein  70.53 
 
 		 510 aa  734    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3504  aldehyde dehydrogenase  70.08 
 
 		 522 aa  718    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0908  aldehyde dehydrogenase family protein  70.92 
 
 		 510 aa  738    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41608  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1631  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  68.74 
 
 		 503 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0239  Aldehyde Dehydrogenase  66.86 
 
 		 509 aa  661    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1891  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  65.4 
 
 		 496 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0779  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  68.74 
 
 		 503 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0381383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  66.8 
 
 		 496 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5160  aldehyde dehydrogenase  67.54 
 
 		 503 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.447339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  65.6 
 
 		 496 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1723  aldehyde dehydrogenase  67.26 
 
 		 507 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0310  Aldehyde Dehydrogenase  69.43 
 
 		 512 aa  702    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2515  aldehyde dehydrogenase  66.4 
 
 		 502 aa  677    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2725  aldehyde dehydrogenase  65.67 
 
 		 494 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0495  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  68.74 
 
 		 535 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8483  Aldehyde Dehydrogenase  67.92 
 
 		 522 aa  701    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0550  aldehyde dehydrogenase  65 
 
 		 496 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.499544  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1292  putative aldehyde dehydrogenase  65.07 
 
 		 494 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0380  aldehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 503 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2375  aldehyde dehydrogenase  63.83 
 
 		 505 aa  655    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1983  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  68.74 
 
 		 535 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0285  aldehyde dehydrogenase  67.47 
 
 		 506 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0898  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  68.94 
 
 		 503 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0880  aldehyde dehydrogenase  70.55 
 
 		 510 aa  722    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3228  aldehyde dehydrogenase  68.67 
 
 		 504 aa  711    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.970783  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  66.8 
 
 		 496 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3784  Aldehyde Dehydrogenase  78.54 
 
 		 512 aa  810    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.888405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3952  aldehyde dehydrogenase  63.81 
 
 		 507 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338759  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3186  aldehyde dehydrogenase  68.84 
 
 		 506 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  65.47 
 
 		 494 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2578  putative aldehyde dehydrogenase family protein  63.15 
 
 		 499 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0566  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  68.74 
 
 		 535 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  66.8 
 
 		 496 aa  675    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1249  putative aldehyde dehydrogenase  77.8 
 
 		 517 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.586964  normal  0.195396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3159  aldehyde dehydrogenase  71.76 
 
 		 510 aa  747    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3110  aldehyde dehydrogenase  68.38 
 
 		 503 aa  678    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0895  aldehyde dehydrogenase  64.93 
 
 		 496 aa  674    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6596  Aldehyde Dehydrogenase  63.35 
 
 		 499 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173575  normal  0.169745 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0678  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  68.74 
 
 		 535 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.808953  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2655  aldehyde dehydrogenase  66.27 
 
 		 502 aa  675    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1810  aldehyde dehydrogenase  70.4 
 
 		 507 aa  691    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3097  aldehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 503 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1459  aldehyde dehydrogenase  71.32 
 
 		 510 aa  740    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2080  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  68.74 
 
 		 535 aa  670    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3627  aldehyde dehydrogenase  74.02 
 
 		 503 aa  745    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.225192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0787  aldehyde dehydrogenase  68.77 
 
 		 511 aa  693    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.802258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2411  aldehyde dehydrogenase  73.67 
 
 		 516 aa  758    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4630  aldehyde dehydrogenase  67.33 
 
 		 503 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1201  Aldehyde Dehydrogenase  72.78 
 
 		 508 aa  733    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4356  aldehyde dehydrogenase  68.21 
 
 		 497 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3451  aldehyde dehydrogenase  67.13 
 
 		 503 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5719  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 511 aa  1033    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51050  aldehyde dehydrogenase  67.99 
 
 		 529 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.790236  hitchhiker  0.000000280962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5270  aldehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 571 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.295049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4998  aldehyde dehydrogenase  66.93 
 
 		 503 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4113  Aldehyde Dehydrogenase  79.33 
 
 		 512 aa  830    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3885  aldehyde dehydrogenase  63.55 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3207  aldehyde dehydrogenase  63.17 
 
 		 507 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1939  Aldehyde Dehydrogenase  64.57 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4799  aldehyde dehydrogenase  62.86 
 
 		 513 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0565  aldehyde dehydrogenase  61 
 
 		 506 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.254181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1935  Aldehyde Dehydrogenase  62.42 
 
 		 515 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04370  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  62.27 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0694384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1643  aldehyde dehydrogenase  63.12 
 
 		 514 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1270  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  62.63 
 
 		 529 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5034  Aldehyde Dehydrogenase  58.28 
 
 		 512 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.96279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1287  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  62.63 
 
 		 529 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.195154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1297  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  62.06 
 
 		 530 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3050  aldehyde dehydrogenase  61.36 
 
 		 505 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2418  Aldehyde Dehydrogenase  55.53 
 
 		 509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3681  Aldehyde Dehydrogenase  56.69 
 
 		 509 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.160701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02440  probable piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  55.89 
 
 		 517 aa  558  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.145685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13322  piperideine-6-carboxilic acid dehydrogenase pcd  62.99 
 
 		 494 aa  561  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3946  Aldehyde Dehydrogenase  59.19 
 
 		 501 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1225  aldehyde dehydrogenase  56.06 
 
 		 517 aa  554  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0720  aldehyde dehydrogenase  56.49 
 
 		 514 aa  554  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0053  NAD+-dependent aldehyde dehydrogenase  54.26 
 
 		 513 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294744 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1305  hypothetical protein  54.02 
 
 		 506 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1304  hypothetical protein  54.02 
 
 		 506 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3069  Aldehyde Dehydrogenase  55.62 
 
 		 508 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00203501  normal  0.959817 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  53.04 
 
 		 513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00811  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  55.12 
 
 		 526 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1728  Aldehyde Dehydrogenase  53 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193131  normal  0.860615 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07130  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+], putative  43.79 
 
 		 581 aa  415  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  36.78 
 
 		 493 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  35.5 
 
 		 498 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  35.85 
 
 		 496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  34.85 
 
 		 500 aa  282  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  37.08 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  34.89 
 
 		 499 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  37.05 
 
 		 516 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  34.29 
 
 		 503 aa  257  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  34.66 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  32.64 
 
 		 493 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  35.06 
 
 		 498 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  34.09 
 
 		 497 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  32.92 
 
 		 505 aa  246  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>