More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2418 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3069  Aldehyde Dehydrogenase  65.94 
 
 
508 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00203501  normal  0.959817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3681  Aldehyde Dehydrogenase  74.02 
 
 
509 aa  780    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.160701 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1304  hypothetical protein  61.69 
 
 
506 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1225  aldehyde dehydrogenase  71.12 
 
 
517 aa  756    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5034  Aldehyde Dehydrogenase  65.42 
 
 
512 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.96279  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02440  probable piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  70.92 
 
 
517 aa  751    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.145685  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2418  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
509 aa  1051    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1305  hypothetical protein  61.49 
 
 
506 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1728  Aldehyde Dehydrogenase  61.94 
 
 
510 aa  626  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193131  normal  0.860615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00811  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  62.3 
 
 
526 aa  627  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0053  NAD+-dependent aldehyde dehydrogenase  58.4 
 
 
513 aa  620  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2725  aldehyde dehydrogenase  57.96 
 
 
494 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  61.68 
 
 
496 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  61.89 
 
 
496 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  58.94 
 
 
496 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3451  aldehyde dehydrogenase  56.4 
 
 
503 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208347  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  59.75 
 
 
494 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  61.68 
 
 
496 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  61.68 
 
 
496 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_003296  RS02148  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  57.5 
 
 
504 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  56.5 
 
 
513 aa  588  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1292  putative aldehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
494 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0898  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.2 
 
 
503 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5160  aldehyde dehydrogenase  55.23 
 
 
503 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.447339 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0908  aldehyde dehydrogenase family protein  57.2 
 
 
510 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1891  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  58.55 
 
 
496 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0285  aldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
506 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0851  aldehyde dehydrogenase family protein  57 
 
 
510 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3097  aldehyde dehydrogenase  55.62 
 
 
503 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0495  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.59 
 
 
535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4356  aldehyde dehydrogenase  58.01 
 
 
497 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0550  aldehyde dehydrogenase  58.89 
 
 
496 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.499544  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1459  aldehyde dehydrogenase  57 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5270  aldehyde dehydrogenase  55.62 
 
 
571 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.295049  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0678  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.4 
 
 
535 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.808953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0566  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.4 
 
 
535 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745334  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1983  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.59 
 
 
535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2080  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.59 
 
 
535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4630  aldehyde dehydrogenase  55.04 
 
 
503 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51050  aldehyde dehydrogenase  57.45 
 
 
529 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.790236  hitchhiker  0.000000280962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4998  aldehyde dehydrogenase  55.43 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0779  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.4 
 
 
503 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0381383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2411  aldehyde dehydrogenase  55.38 
 
 
516 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0380  aldehyde dehydrogenase  55.23 
 
 
503 aa  581  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2655  aldehyde dehydrogenase  59.12 
 
 
502 aa  578  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3159  aldehyde dehydrogenase  58.92 
 
 
510 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510599  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1631  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.4 
 
 
503 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0895  aldehyde dehydrogenase  59.83 
 
 
496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4113  Aldehyde Dehydrogenase  58.02 
 
 
512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189618  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5719  aldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1201  Aldehyde Dehydrogenase  58.75 
 
 
508 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3228  aldehyde dehydrogenase  57.73 
 
 
504 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.970783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1249  putative aldehyde dehydrogenase  54.47 
 
 
517 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.586964  normal  0.195396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1810  aldehyde dehydrogenase  57.83 
 
 
507 aa  570  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2375  aldehyde dehydrogenase  55.29 
 
 
505 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2578  putative aldehyde dehydrogenase family protein  54.4 
 
 
499 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3784  Aldehyde Dehydrogenase  58.23 
 
 
512 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.888405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3627  aldehyde dehydrogenase  56.41 
 
 
503 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.225192  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04370  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  56.88 
 
 
502 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0694384  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6596  Aldehyde Dehydrogenase  53.82 
 
 
499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173575  normal  0.169745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3885  aldehyde dehydrogenase  55.38 
 
 
499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0880  aldehyde dehydrogenase  53.89 
 
 
510 aa  552  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4799  aldehyde dehydrogenase  55.67 
 
 
513 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1723  aldehyde dehydrogenase  56.08 
 
 
507 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8483  Aldehyde Dehydrogenase  55.25 
 
 
522 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1643  aldehyde dehydrogenase  55.88 
 
 
514 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3504  aldehyde dehydrogenase  52.2 
 
 
522 aa  547  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3110  aldehyde dehydrogenase  53.23 
 
 
503 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0310  Aldehyde Dehydrogenase  54.6 
 
 
512 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1287  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  55.88 
 
 
529 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0720  aldehyde dehydrogenase  52.06 
 
 
514 aa  541  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1270  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  55.88 
 
 
529 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2515  aldehyde dehydrogenase  52.54 
 
 
502 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0787  aldehyde dehydrogenase  54.32 
 
 
511 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.802258  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1297  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  55.62 
 
 
530 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0161  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  54.07 
 
 
503 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221035  normal  0.540885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1935  Aldehyde Dehydrogenase  53.94 
 
 
515 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1939  Aldehyde Dehydrogenase  56.87 
 
 
510 aa  537  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0239  Aldehyde Dehydrogenase  54.64 
 
 
509 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3207  aldehyde dehydrogenase  54.79 
 
 
507 aa  535  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0565  aldehyde dehydrogenase  50.78 
 
 
506 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.254181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3946  Aldehyde Dehydrogenase  52.51 
 
 
501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3952  aldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 
507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338759  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13322  piperideine-6-carboxilic acid dehydrogenase pcd  55.25 
 
 
494 aa  512  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3186  aldehyde dehydrogenase  56.13 
 
 
506 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3050  aldehyde dehydrogenase  54.93 
 
 
505 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07130  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+], putative  45.75 
 
 
581 aa  442  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  38.32 
 
 
503 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  37.91 
 
 
497 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  35.08 
 
 
498 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 
516 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  36.21 
 
 
499 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  36.46 
 
 
500 aa  294  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  37.84 
 
 
493 aa  293  7e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  35.62 
 
 
493 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  36.14 
 
 
496 aa  289  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2343  Aldehyde Dehydrogenase  35.52 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135718  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  35.85 
 
 
496 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0807  Aldehyde Dehydrogenase  32.86 
 
 
520 aa  283  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2331  Aldehyde Dehydrogenase  33.33 
 
 
581 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>