More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0217 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  68.17 
 
 
531 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
520 aa  1046    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  83.78 
 
 
518 aa  837    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  67.43 
 
 
531 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  84.78 
 
 
519 aa  834    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  67.25 
 
 
531 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  81.07 
 
 
523 aa  788    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  77.43 
 
 
516 aa  758    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.09 
 
 
681 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.37 
 
 
679 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 
675 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.16 
 
 
686 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.47 
 
 
690 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  46.25 
 
 
686 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.29 
 
 
683 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.44 
 
 
686 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
678 aa  388  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.77 
 
 
675 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
678 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
676 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.81 
 
 
688 aa  379  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
687 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.16 
 
 
686 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.74 
 
 
685 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 
684 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.79 
 
 
681 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.6 
 
 
681 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.6 
 
 
681 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 
691 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.6 
 
 
681 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
679 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
674 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.99 
 
 
678 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
682 aa  355  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 
683 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  44.16 
 
 
517 aa  353  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 
690 aa  352  8e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.26 
 
 
695 aa  352  8e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.11 
 
 
686 aa  350  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.32 
 
 
678 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
664 aa  348  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
836 aa  342  7e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.42 
 
 
703 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
702 aa  329  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 
706 aa  329  6e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 
683 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 
684 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.35 
 
 
683 aa  326  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.16 
 
 
684 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.16 
 
 
684 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  27.49 
 
 
470 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  26.68 
 
 
517 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  26.37 
 
 
512 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 
505 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  28.89 
 
 
470 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  28.97 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  27.94 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  28.78 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  27.94 
 
 
476 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.69 
 
 
486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  27.73 
 
 
476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  28.99 
 
 
505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  29.09 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  29.09 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  29.35 
 
 
478 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  30.05 
 
 
478 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  27.18 
 
 
505 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  26.99 
 
 
485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  28.3 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.57 
 
 
502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  26.83 
 
 
505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  26.12 
 
 
510 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.47 
 
 
481 aa  113  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1793  aldehyde dehydrogenase  28.46 
 
 
478 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1306  aldehyde dehydrogenase  28.46 
 
 
478 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1063  aldehyde dehydrogenase  28.46 
 
 
478 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0102  aldehyde dehydrogenase  28.46 
 
 
478 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.5 
 
 
486 aa  113  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2317  aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2271  aldehyde dehydrogenase  28.95 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2184  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  28.57 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  30.65 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  26.88 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  26.59 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2129  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  28.57 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7323  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.7 
 
 
469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2878  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.62 
 
 
473 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0192493  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.62 
 
 
483 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  27.94 
 
 
495 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0829  aldehyde dehydrogenase  28.29 
 
 
473 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0312676  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.64 
 
 
496 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.32 
 
 
500 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1505  aldehyde dehydrogenase  27.21 
 
 
478 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1338  Aldehyde Dehydrogenase  28.08 
 
 
478 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  26.17 
 
 
503 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  30.22 
 
 
488 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  24.69 
 
 
482 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  28.79 
 
 
477 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.96 
 
 
496 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3377  aldehyde dehydrogenase  31.45 
 
 
482 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>