More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3071 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  70.99 
 
 
681 aa  955    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.72 
 
 
678 aa  669    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 
684 aa  752    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.36 
 
 
683 aa  734    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.13 
 
 
681 aa  674    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.58 
 
 
682 aa  756    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  71.28 
 
 
681 aa  957    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
675 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  49.78 
 
 
836 aa  655    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
690 aa  1420    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.06 
 
 
684 aa  757    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.94 
 
 
686 aa  792    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.68 
 
 
679 aa  788    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.07 
 
 
675 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
684 aa  755    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.39 
 
 
678 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.71 
 
 
690 aa  788    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.07 
 
 
691 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.62 
 
 
695 aa  730    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.35 
 
 
676 aa  672    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  71.28 
 
 
681 aa  958    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  70.85 
 
 
681 aa  953    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.55 
 
 
684 aa  759    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.39 
 
 
683 aa  893    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.08 
 
 
686 aa  728    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.88 
 
 
686 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.41 
 
 
686 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.88 
 
 
683 aa  741    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.51 
 
 
687 aa  633  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  50.52 
 
 
686 aa  631  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  50.51 
 
 
678 aa  625  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.18 
 
 
679 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.71 
 
 
685 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.56 
 
 
678 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.34 
 
 
664 aa  607  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.34 
 
 
674 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.23 
 
 
683 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.18 
 
 
706 aa  589  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.44 
 
 
688 aa  580  1e-164  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.91 
 
 
702 aa  568  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.37 
 
 
703 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  42.33 
 
 
531 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  41.86 
 
 
531 aa  359  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  43.58 
 
 
519 aa  359  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  44.06 
 
 
516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
518 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  41.07 
 
 
531 aa  351  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
523 aa  346  7e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  41.21 
 
 
517 aa  341  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  43.44 
 
 
520 aa  340  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  37.45 
 
 
515 aa  141  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  25.68 
 
 
496 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  25.68 
 
 
496 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  26.89 
 
 
510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  26.99 
 
 
485 aa  118  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  28.32 
 
 
490 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  26.98 
 
 
529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  26.78 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  28.48 
 
 
490 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  28.48 
 
 
490 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  27.31 
 
 
463 aa  114  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  25.79 
 
 
517 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  32.27 
 
 
474 aa  110  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  29.39 
 
 
494 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  26.58 
 
 
487 aa  110  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  28.34 
 
 
478 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  28.25 
 
 
490 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  25.5 
 
 
512 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  24.9 
 
 
490 aa  108  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  26.18 
 
 
493 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4733  betaine aldehyde dehydrogenase  27.95 
 
 
490 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1514  betaine aldehyde dehydrogenase  26.54 
 
 
490 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0736273  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  24.6 
 
 
496 aa  107  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  25.06 
 
 
474 aa  107  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.01 
 
 
483 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  25.39 
 
 
478 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  43.33 
 
 
148 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3725  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.89 
 
 
502 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00268  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  27.32 
 
 
490 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00271  hypothetical protein  27.32 
 
 
490 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.802759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  27.82 
 
 
490 aa  106  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0554  aldehyde dehydrogenase  23.95 
 
 
476 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000239131  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  25.06 
 
 
474 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.23 
 
 
502 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0343  betaine aldehyde dehydrogenase  27.51 
 
 
490 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1799  Aldehyde Dehydrogenase  28.33 
 
 
452 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  24.94 
 
 
482 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  26.23 
 
 
478 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  26.05 
 
 
478 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0327  betaine aldehyde dehydrogenase  27.32 
 
 
490 aa  104  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  26.05 
 
 
478 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0762  aldehyde dehydrogenase  26.1 
 
 
475 aa  103  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.338463  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.49 
 
 
493 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0374  betaine aldehyde dehydrogenase  27.13 
 
 
490 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0441  betaine aldehyde dehydrogenase BADH  27.41 
 
 
490 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  26.46 
 
 
462 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  27.24 
 
 
478 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  24.43 
 
 
482 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  27.22 
 
 
490 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.934353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>