222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1607 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  100 
 
 
515 aa  1023    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.89 
 
 
686 aa  231  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.78 
 
 
691 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
686 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.64 
 
 
686 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.72 
 
 
706 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.75 
 
 
681 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.41 
 
 
687 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.67 
 
 
678 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.49 
 
 
675 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52 
 
 
678 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.85 
 
 
685 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.86 
 
 
679 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
674 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.71 
 
 
678 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.72 
 
 
683 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.43 
 
 
675 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.35 
 
 
688 aa  166  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.51 
 
 
676 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.65 
 
 
702 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.09 
 
 
664 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 
703 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.75 
 
 
678 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.65 
 
 
690 aa  153  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.96 
 
 
695 aa  140  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.62 
 
 
686 aa  140  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 
686 aa  140  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 
690 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.08 
 
 
684 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.85 
 
 
681 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.85 
 
 
681 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
681 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  41.3 
 
 
681 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 
682 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.39 
 
 
683 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  41.53 
 
 
679 aa  134  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
684 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.76 
 
 
684 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.76 
 
 
684 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
836 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
683 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.4 
 
 
683 aa  124  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  41.18 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  34.81 
 
 
146 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  34.07 
 
 
146 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  34.06 
 
 
148 aa  70.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  32.64 
 
 
166 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  39.13 
 
 
147 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  35.56 
 
 
153 aa  64.3  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  35.07 
 
 
148 aa  63.9  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  35.87 
 
 
141 aa  63.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  31.62 
 
 
147 aa  63.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  38.3 
 
 
156 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.21 
 
 
500 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  37.5 
 
 
157 aa  61.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  35.46 
 
 
156 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  39.05 
 
 
154 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  36.56 
 
 
144 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  30.88 
 
 
160 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  36.26 
 
 
139 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  26.25 
 
 
517 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3102  MaoC domain protein dehydratase  37.08 
 
 
153 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  35.71 
 
 
164 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  35.16 
 
 
135 aa  55.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  32.46 
 
 
156 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  37.89 
 
 
464 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1227  dehydratase  39.29 
 
 
179 aa  53.5  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6842  dehydratase  30.88 
 
 
158 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  34.38 
 
 
149 aa  53.5  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  35.71 
 
 
154 aa  53.5  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2239  dehydratase  38.82 
 
 
138 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.12703  normal  0.929294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7557  MaoC-like dehydratase  29.13 
 
 
178 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  34.19 
 
 
151 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.84 
 
 
470 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  31.82 
 
 
185 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  31.65 
 
 
149 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  36.67 
 
 
140 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  29.46 
 
 
152 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  33.82 
 
 
175 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  31.43 
 
 
150 aa  52.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  31.33 
 
 
158 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  34.23 
 
 
158 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  32.71 
 
 
147 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  35.71 
 
 
184 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  35.78 
 
 
149 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1832  dehydratase  31.19 
 
 
155 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  32.71 
 
 
147 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  28.95 
 
 
156 aa  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1468  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33 
 
 
478 aa  51.2  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  29.2 
 
 
160 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  33.33 
 
 
158 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  32.71 
 
 
147 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  32.22 
 
 
158 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  38.46 
 
 
147 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.46 
 
 
147 aa  50.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.46 
 
 
147 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  38.46 
 
 
147 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  38.46 
 
 
147 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  38.46 
 
 
147 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>