More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1913 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.24 
 
 
687 aa  660    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.51 
 
 
684 aa  746    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.46 
 
 
681 aa  731    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.64 
 
 
684 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 
686 aa  729    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  65.29 
 
 
679 aa  926    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.23 
 
 
683 aa  712    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  49.85 
 
 
836 aa  661    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.8 
 
 
681 aa  726    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
681 aa  716    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  59.44 
 
 
690 aa  779    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.57 
 
 
678 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
675 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.87 
 
 
681 aa  728    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 
678 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.89 
 
 
685 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.62 
 
 
690 aa  723    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.1 
 
 
683 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 
682 aa  721    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.69 
 
 
678 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.43 
 
 
686 aa  709    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.98 
 
 
691 aa  697    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
695 aa  1397    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.59 
 
 
675 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.03 
 
 
683 aa  752    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.17 
 
 
679 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.34 
 
 
684 aa  703    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.93 
 
 
684 aa  712    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  65.98 
 
 
686 aa  897    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.55 
 
 
686 aa  724    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.49 
 
 
686 aa  731    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.02 
 
 
681 aa  726    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.37 
 
 
683 aa  682    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
678 aa  625  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.15 
 
 
674 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.52 
 
 
676 aa  625  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.69 
 
 
688 aa  615  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.14 
 
 
706 aa  601  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.74 
 
 
664 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.86 
 
 
702 aa  591  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.99 
 
 
703 aa  590  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
531 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
531 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
531 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
519 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 
518 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  43.44 
 
 
523 aa  352  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
516 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  42.95 
 
 
517 aa  347  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  41.26 
 
 
520 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  43.96 
 
 
515 aa  140  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  30.1 
 
 
485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  33.99 
 
 
487 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  30.37 
 
 
496 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  27.91 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  31.27 
 
 
478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0382  aldehyde dehydrogenase  30.39 
 
 
491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.515832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  29.61 
 
 
487 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  28.04 
 
 
496 aa  118  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  29.8 
 
 
512 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  26.81 
 
 
496 aa  117  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.37 
 
 
500 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  26.81 
 
 
496 aa  117  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  29.58 
 
 
517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.46 
 
 
476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
517 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.522352  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  34.55 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.81 
 
 
498 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  32.79 
 
 
491 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  32.79 
 
 
491 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  26.17 
 
 
485 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5498  aldehyde dehydrogenase  26.93 
 
 
487 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.61 
 
 
500 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4763  Aldehyde Dehydrogenase  28.35 
 
 
500 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  32.47 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  28.43 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0237  Betaine-aldehyde dehydrogenase  29.47 
 
 
493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  28.32 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  27.88 
 
 
491 aa  112  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  28.05 
 
 
506 aa  112  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  27.65 
 
 
493 aa  112  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  32.46 
 
 
474 aa  111  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  28.43 
 
 
476 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  29.16 
 
 
494 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  27.02 
 
 
529 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  28.9 
 
 
475 aa  110  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  28.9 
 
 
475 aa  110  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  26.81 
 
 
463 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2352  aldehyde dehydrogenase  29.27 
 
 
474 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.448726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.61 
 
 
490 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
496 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5206  2-aminomuconic 6-semialdehyde dehydrogenase  28.27 
 
 
487 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.532716  normal  0.251126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.01 
 
 
477 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  26.62 
 
 
492 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5157  aldehyde dehydrogenase  28.11 
 
 
489 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204218  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3778  aldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 
489 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1768  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.26 
 
 
1002 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3410  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
506 aa  107  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1403  Aldehyde Dehydrogenase  31.93 
 
 
478 aa  107  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  29.4 
 
 
483 aa  107  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>