134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_463 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  94.16 
 
 		 137 aa  262  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  86.13 
 
 		 137 aa  241  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  32.33 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  31.85 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  32.61 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  28.89 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  31.88 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  31.88 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  32.77 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  31.09 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  34.13 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  31.03 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  31.11 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  30.97 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  31.53 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  32.74 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  30.37 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  30.37 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  31.85 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  29.79 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  29.66 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  30.77 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  37.23 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  30.63 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  28.79 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  24.65 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  36.14 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  34.15 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  36.14 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  29.7 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  36.14 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  29.41 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  30.37 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  49.06 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  36.47 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  32.03 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  29.46 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  29.67 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  27.52 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  28.15 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  29.93 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  30 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  33.73 
 
 		 343 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  31.96 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  32.73 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  35.09 
 
 		 337 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  34.83 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  30.68 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  32.89 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  32.89 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  35 
 
 		 343 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  35.23 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  29.69 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  28.83 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  31.4 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  33.75 
 
 		 339 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  33.72 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  28.3 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  26.17 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  29.76 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  25.2 
 
 		 322 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  36.23 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.07 
 
 		 481 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.07 
 
 		 481 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  28.3 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4178  dehydratase  27.43 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  26.97 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  27.27 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  29.27 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6628  dehydratase  32.94 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.211111  normal  0.931834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  30.17 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  26.72 
 
 		 326 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  26.27 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  27.05 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  28.89 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  27.05 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  24.58 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  27.05 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  30.88 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  27.21 
 
 		 332 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  26.98 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  27.21 
 
 		 332 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  24.09 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  25.51 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  34.72 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  31.67 
 
 		 335 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  24.17 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  39.34 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  25 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  23.58 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  26.25 
 
 		 173 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2974  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.27 
 
 		 473 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.530032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  25.93 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1790  maoC family protein  37.5 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00332873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1929  MaoC family protein  37.5 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.988718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  25.93 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>