274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3812 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
140 aa  288  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  87.59 
 
 
137 aa  249  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  82.86 
 
 
141 aa  244  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  58.46 
 
 
141 aa  153  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  52.14 
 
 
141 aa  150  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  55.73 
 
 
138 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  53.44 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  57.26 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  51.91 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  52.76 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  50.38 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  51.15 
 
 
136 aa  135  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  50.38 
 
 
138 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  50.77 
 
 
139 aa  133  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  49.62 
 
 
138 aa  133  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  49.64 
 
 
138 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  49.64 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  49.64 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  46.04 
 
 
141 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  40.62 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  40.62 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  40.62 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  38.4 
 
 
322 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  37.6 
 
 
326 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  34.17 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  36.64 
 
 
332 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  36.64 
 
 
332 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  35.77 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  32.26 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  32.03 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  29.93 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  35.04 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  42.86 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  32.35 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  32.64 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  35.85 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  31.62 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  36.52 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  36.07 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  37.93 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  34.78 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  31.29 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  31.69 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  31.25 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  39.42 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  32.77 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  41.67 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  35.61 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  41.67 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  41.67 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  35.92 
 
 
339 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  32.52 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  32.77 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  34.59 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  40.96 
 
 
343 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  30.66 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  34.72 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  34.88 
 
 
337 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.47 
 
 
282 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  37.14 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  33.65 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  30.37 
 
 
335 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  30.63 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  42.17 
 
 
343 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  37.04 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  44.44 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  31.58 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  34.86 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  30.71 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  34.35 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  32.67 
 
 
279 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  29.69 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  29.69 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  36.92 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  27.66 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  29.66 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  34.02 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  38.27 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0193  dehydratase  29.63 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  29.77 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  33.66 
 
 
286 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  29.69 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  28.91 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  33.66 
 
 
286 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  33.66 
 
 
286 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  29.77 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.57 
 
 
471 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  32.2 
 
 
184 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.26 
 
 
283 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  28.12 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  29.23 
 
 
286 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  29.63 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  32.99 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  31.82 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0370  MaoC domain protein dehydratase  28.79 
 
 
130 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.758804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  32.98 
 
 
278 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  30.7 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.9 
 
 
500 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>