150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1800 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  100 
 
 
282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  71.17 
 
 
283 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  44.48 
 
 
288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  47.18 
 
 
285 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.05 
 
 
283 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  43.61 
 
 
288 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
710 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  42.86 
 
 
291 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.44 
 
 
315 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.3 
 
 
278 aa  175  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  39.93 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  39.65 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  38.75 
 
 
903 aa  172  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  39.71 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  39.71 
 
 
286 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  39.71 
 
 
286 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  39.71 
 
 
286 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  39.93 
 
 
289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  37.17 
 
 
286 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  39.93 
 
 
289 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  39.93 
 
 
289 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  39.51 
 
 
297 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  44.4 
 
 
290 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  41.18 
 
 
893 aa  169  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.21 
 
 
286 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.78 
 
 
297 aa  168  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  40.08 
 
 
286 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.56 
 
 
285 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  38.49 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  39.69 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  38.66 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  38.91 
 
 
282 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  37.87 
 
 
286 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  38.21 
 
 
287 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.43 
 
 
286 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.53 
 
 
286 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  40.38 
 
 
265 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  38.43 
 
 
290 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  38.64 
 
 
286 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
283 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  37.8 
 
 
288 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  37.89 
 
 
288 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  34.15 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  37.9 
 
 
291 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.59 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  31.6 
 
 
901 aa  132  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  30.47 
 
 
295 aa  128  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.16 
 
 
289 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  33.33 
 
 
316 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.42 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  29.41 
 
 
283 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  29.26 
 
 
283 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  28.63 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  33.8 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  32.03 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  40.2 
 
 
137 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  43.48 
 
 
141 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  34.4 
 
 
2111 aa  58.9  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  36.47 
 
 
140 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  30.18 
 
 
3087 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  40.91 
 
 
138 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1994  MaoC domain protein dehydratase  27.31 
 
 
3083 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  35 
 
 
146 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  27.48 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  35 
 
 
135 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  37.66 
 
 
138 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  37.66 
 
 
138 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  37.66 
 
 
138 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  29.75 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  36 
 
 
135 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  35 
 
 
135 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  42.86 
 
 
137 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  35.79 
 
 
141 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  28.7 
 
 
3097 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  27.08 
 
 
335 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07814  Putative sterigmatocystin biosynthesis fatty acid synthase subunit beta [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00706]  26.13 
 
 
1914 aa  52.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  27.5 
 
 
137 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  24.77 
 
 
284 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  29.17 
 
 
147 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  23.44 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0370  MaoC domain protein dehydratase  41.79 
 
 
130 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.758804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  30.93 
 
 
141 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  34.48 
 
 
139 aa  49.7  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  29.25 
 
 
2513 aa  49.7  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  30.68 
 
 
1872 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0972  dehydratase  28.46 
 
 
184 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  25.95 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  37.97 
 
 
141 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  39.39 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  30.77 
 
 
3077 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  30.77 
 
 
3077 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  28.66 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  30.77 
 
 
3075 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12545  fatty acid synthase fas  33 
 
 
3069 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.696473  decreased coverage  0.00343939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  26.67 
 
 
283 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  28.45 
 
 
138 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  34.06 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  37.7 
 
 
140 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  29.51 
 
 
322 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  37.18 
 
 
137 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>