124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0139 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  96.3 
 
 
297 aa  551  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  85.52 
 
 
315 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  84.85 
 
 
297 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  54.21 
 
 
285 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  52.35 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  47.81 
 
 
291 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  50.67 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  51.68 
 
 
291 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  51.54 
 
 
288 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  48.99 
 
 
289 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  48.47 
 
 
288 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.22 
 
 
283 aa  235  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.37 
 
 
286 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  47.99 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  38.72 
 
 
286 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  38.72 
 
 
286 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.95 
 
 
286 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  36.12 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  42.69 
 
 
291 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.44 
 
 
282 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  36.27 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.78 
 
 
288 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.07 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  40.37 
 
 
285 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  38.41 
 
 
290 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.56 
 
 
285 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  39.5 
 
 
276 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  37.7 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.18 
 
 
278 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  38.89 
 
 
289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  38.89 
 
 
289 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  34.91 
 
 
286 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  38.49 
 
 
289 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  34.56 
 
 
286 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  36.3 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  37.06 
 
 
893 aa  140  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  38.22 
 
 
287 aa  139  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
710 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  35.83 
 
 
286 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  35.83 
 
 
286 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  35.83 
 
 
286 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  35.25 
 
 
282 aa  132  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  35.19 
 
 
903 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  31.75 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  32.06 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  34.01 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  30.74 
 
 
901 aa  112  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31.56 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  30.11 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
283 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 
295 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  29.96 
 
 
283 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  28.05 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  32.04 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  26.17 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  36.63 
 
 
135 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  33.75 
 
 
3077 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  33.75 
 
 
3077 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  33.75 
 
 
3075 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  40.3 
 
 
146 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  40.3 
 
 
135 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  34.75 
 
 
141 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  40.3 
 
 
135 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  26.79 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  30.32 
 
 
3087 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  34.62 
 
 
154 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12545  fatty acid synthase fas  33.56 
 
 
3069 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.696473  decreased coverage  0.00343939 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  41.43 
 
 
2111 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  29.03 
 
 
3097 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  35.06 
 
 
148 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  35.06 
 
 
156 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  30.77 
 
 
139 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  30.1 
 
 
184 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  41.1 
 
 
137 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  32.86 
 
 
151 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  29.38 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  28.35 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  29.44 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0858  putative dehydratase  40 
 
 
127 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586377  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  29.35 
 
 
145 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  26.83 
 
 
141 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 
1872 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  30.56 
 
 
173 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  27.86 
 
 
156 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  31.17 
 
 
152 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  39.06 
 
 
143 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  29.63 
 
 
156 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  45.76 
 
 
131 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  25.42 
 
 
147 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  29.63 
 
 
156 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  33.33 
 
 
144 aa  45.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  30.26 
 
 
147 aa  45.8  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  29.63 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  29.63 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  36.78 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  31.96 
 
 
147 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  32.11 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  30 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  27.93 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>