109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0894 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  100 
 
 
287 aa  578  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  62.02 
 
 
285 aa  325  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  58.8 
 
 
286 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  58.8 
 
 
286 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  58.8 
 
 
286 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  57.8 
 
 
286 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  56.69 
 
 
286 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  58.62 
 
 
282 aa  301  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  56.74 
 
 
286 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  55.52 
 
 
278 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  55.56 
 
 
276 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  53.12 
 
 
285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  42.7 
 
 
286 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.24 
 
 
283 aa  208  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.16 
 
 
286 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  41.42 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  41.42 
 
 
286 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  40.29 
 
 
288 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  39.21 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  42.14 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  40.78 
 
 
286 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  41.01 
 
 
291 aa  178  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  36.46 
 
 
285 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.61 
 
 
286 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  37.89 
 
 
286 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  44.11 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  44.11 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
710 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  43.73 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  36.36 
 
 
291 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  38.33 
 
 
290 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.46 
 
 
282 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.13 
 
 
289 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  36.49 
 
 
290 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  36.14 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  35.04 
 
 
893 aa  147  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.39 
 
 
283 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  40.3 
 
 
265 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  35.06 
 
 
903 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  35.84 
 
 
297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.85 
 
 
289 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  38.61 
 
 
297 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.22 
 
 
297 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.63 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.02 
 
 
315 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  32.95 
 
 
901 aa  125  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.6 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  31.92 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
283 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  30.25 
 
 
283 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 
295 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  30.34 
 
 
316 aa  89.4  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  32.39 
 
 
297 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  27.34 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  30.1 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  29.68 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  25.98 
 
 
284 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  45 
 
 
163 aa  54.7  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  36.62 
 
 
1872 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  24.44 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  26.7 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  25.97 
 
 
156 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  28.93 
 
 
337 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  27.56 
 
 
147 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  32.32 
 
 
138 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  36.99 
 
 
148 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  26.14 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  34.78 
 
 
140 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  41.54 
 
 
150 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  43.14 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  31.65 
 
 
147 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  31.58 
 
 
140 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  32.93 
 
 
148 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  28.33 
 
 
133 aa  47.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  33.04 
 
 
153 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
139 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  43.18 
 
 
147 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  35.9 
 
 
145 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  28.67 
 
 
148 aa  45.8  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  28.17 
 
 
2513 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  43.59 
 
 
134 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  45.45 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85125  Fatty acid synthase subunit beta Includes: 3-hydroxypalmitoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase; Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]; [Acyl-carrier-protein] acetyltransferase; [Acyl-carrier-protein] malonyltransferase; S-acyl fatty acid synthase thioesterase  37.88 
 
 
2075 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  34.21 
 
 
141 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  39.06 
 
 
141 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  28.76 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3533  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
138 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  32 
 
 
142 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  27.05 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  32 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  38.03 
 
 
141 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  27.37 
 
 
135 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  28.02 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  32.69 
 
 
2111 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  31.37 
 
 
157 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  36.51 
 
 
142 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
141 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  26.95 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  31.58 
 
 
142 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
137 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>