156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5896 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
285 aa  577  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  53.12 
 
 
287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  51.59 
 
 
286 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  52.26 
 
 
286 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  52.26 
 
 
286 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  52.26 
 
 
286 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  51.93 
 
 
286 aa  261  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  50.87 
 
 
286 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  50.87 
 
 
285 aa  246  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  48.78 
 
 
276 aa  231  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  48.79 
 
 
278 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  48.12 
 
 
282 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.03 
 
 
283 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  47.18 
 
 
282 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  41.4 
 
 
286 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  41.75 
 
 
285 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.21 
 
 
286 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  43.48 
 
 
286 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  42.21 
 
 
286 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  41.83 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  45.85 
 
 
283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  44.81 
 
 
286 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  43.68 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
710 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  38.73 
 
 
288 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  39.79 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  38.73 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  42.7 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  42.8 
 
 
288 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  32.61 
 
 
286 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.07 
 
 
289 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.01 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  41.26 
 
 
291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  41.24 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  43.14 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  41.11 
 
 
297 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  39.15 
 
 
893 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  40.13 
 
 
289 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  40.13 
 
 
289 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  39.41 
 
 
289 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  36.19 
 
 
903 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.84 
 
 
315 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  37.89 
 
 
290 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.64 
 
 
289 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  31.52 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  37.2 
 
 
901 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.82 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  32.5 
 
 
283 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.97 
 
 
265 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
283 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 
295 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  26.87 
 
 
290 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  31.32 
 
 
316 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  29.91 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  28 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  25.41 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  28.37 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1315  MaoC domain protein dehydratase  25.81 
 
 
3102 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  31.21 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  36.11 
 
 
2513 aa  55.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  25 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
1872 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  26.17 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1994  MaoC domain protein dehydratase  27.1 
 
 
3083 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  26.15 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  26.4 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  27.41 
 
 
285 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  28.4 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  23.78 
 
 
285 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  27.11 
 
 
285 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  29.41 
 
 
134 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  30.16 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  30.61 
 
 
3087 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  29.67 
 
 
147 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  26.16 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  30.61 
 
 
3097 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  32.26 
 
 
148 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  35.16 
 
 
147 aa  49.7  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  29.52 
 
 
297 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  42.65 
 
 
140 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  41.18 
 
 
141 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  32.71 
 
 
180 aa  49.3  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  21.43 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  33.66 
 
 
137 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  27.09 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  29.93 
 
 
3077 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  31.4 
 
 
153 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  29.93 
 
 
3077 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  25.32 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  38.57 
 
 
142 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  34.34 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  30.97 
 
 
184 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  23.93 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  32.47 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  27.06 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3256  MaoC domain protein dehydratase  38.18 
 
 
137 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  27.06 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  29.25 
 
 
3075 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  27.06 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  30.3 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>