114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1180 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
289 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  100 
 
 
289 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  99.31 
 
 
289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  75.96 
 
 
288 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  73.87 
 
 
291 aa  411  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  71.08 
 
 
290 aa  408  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  43.02 
 
 
283 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  42.21 
 
 
286 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.65 
 
 
286 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  40.65 
 
 
286 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  40.24 
 
 
286 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  44.2 
 
 
286 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  44.91 
 
 
291 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  42.55 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  43.02 
 
 
286 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  44.15 
 
 
286 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  40.71 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  42.76 
 
 
286 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  42.76 
 
 
286 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  42.76 
 
 
286 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.92 
 
 
283 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.59 
 
 
286 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.93 
 
 
282 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  44.11 
 
 
287 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.62 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  39.18 
 
 
288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
710 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  39.07 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  40.07 
 
 
903 aa  163  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  40.15 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.79 
 
 
289 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.11 
 
 
278 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  41.72 
 
 
282 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  42.7 
 
 
286 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  39.93 
 
 
286 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  39.86 
 
 
276 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.33 
 
 
285 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  37.58 
 
 
285 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  38.89 
 
 
893 aa  151  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  37 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  39.08 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.89 
 
 
297 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  34.88 
 
 
288 aa  135  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  36.33 
 
 
901 aa  135  7.000000000000001e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  38.27 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  33.94 
 
 
283 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.28 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  32.6 
 
 
283 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.16 
 
 
289 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  29.93 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  33.08 
 
 
316 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  29.63 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  32.41 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  31.45 
 
 
1872 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  25.28 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  29.91 
 
 
2513 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  30.81 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  46.27 
 
 
135 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  46.27 
 
 
135 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  29.46 
 
 
337 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  46.27 
 
 
146 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  43.84 
 
 
138 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  28.86 
 
 
144 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  28.86 
 
 
144 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  35.87 
 
 
135 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  34.78 
 
 
2111 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  28.86 
 
 
144 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  30.69 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  36.71 
 
 
127 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  37.08 
 
 
141 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  39.36 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  38.82 
 
 
154 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07814  Putative sterigmatocystin biosynthesis fatty acid synthase subunit beta [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00706]  27.17 
 
 
1914 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  38.24 
 
 
291 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  29.89 
 
 
294 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  28.87 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  35.63 
 
 
140 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  25.12 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  32.52 
 
 
140 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  31.82 
 
 
148 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1315  MaoC domain protein dehydratase  32.53 
 
 
3102 aa  45.8  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  38.37 
 
 
141 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  38.64 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  36.25 
 
 
140 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  37.89 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  23.46 
 
 
159 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  42.62 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  32.29 
 
 
141 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  31.48 
 
 
141 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  35.09 
 
 
3097 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  34.65 
 
 
3087 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  28.67 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  31.22 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  28 
 
 
135 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  34.29 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  40.26 
 
 
133 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  45.9 
 
 
131 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  25.98 
 
 
133 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>