157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1135 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
290 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  83.92 
 
 
286 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  57.95 
 
 
285 aa  338  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  54.26 
 
 
288 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  53.55 
 
 
288 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  51.34 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  52.35 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  50.34 
 
 
315 aa  282  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  52.01 
 
 
297 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  49.31 
 
 
291 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  47.35 
 
 
289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  49.07 
 
 
283 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  49.83 
 
 
291 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  53.95 
 
 
289 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.99 
 
 
286 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  41.91 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  41.67 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.48 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  41.79 
 
 
286 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  43.66 
 
 
286 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  43.8 
 
 
291 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  42.55 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  42.55 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  41.24 
 
 
288 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  42.55 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  41.16 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
710 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  38.98 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  40.91 
 
 
276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  39.26 
 
 
286 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  41.34 
 
 
286 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  40.91 
 
 
290 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  40.48 
 
 
286 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  40.37 
 
 
286 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  40.37 
 
 
286 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  40.37 
 
 
286 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.59 
 
 
288 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.79 
 
 
283 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  37.89 
 
 
893 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.7 
 
 
283 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  36.49 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.19 
 
 
278 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.23 
 
 
283 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.43 
 
 
282 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  38.79 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  35.82 
 
 
903 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  33.86 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
283 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  30.19 
 
 
316 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  33.33 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  32.55 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  30.25 
 
 
901 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  31.06 
 
 
290 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  31.25 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  31.4 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  46.97 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  46.97 
 
 
146 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  46.38 
 
 
135 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  46.97 
 
 
135 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  28.05 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43519  predicted protein  24.22 
 
 
361 aa  59.7  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  29.67 
 
 
337 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
1872 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  32.48 
 
 
137 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  34.07 
 
 
144 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  37.76 
 
 
141 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  38.36 
 
 
154 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  37.04 
 
 
141 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  29.09 
 
 
2513 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  40.28 
 
 
2111 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  38.33 
 
 
142 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  33.06 
 
 
150 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  31.4 
 
 
133 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  34.69 
 
 
142 aa  49.3  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  34.17 
 
 
155 aa  49.3  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  41.67 
 
 
141 aa  49.3  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  37.7 
 
 
142 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  31.65 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  38.1 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0370  MaoC domain protein dehydratase  31.87 
 
 
130 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.758804 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  37.31 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
142 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  30.53 
 
 
147 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  25.7 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  41.67 
 
 
339 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  29.57 
 
 
140 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  31.94 
 
 
134 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3661  dehydratase  27.73 
 
 
148 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.831738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  38.33 
 
 
131 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  30.53 
 
 
147 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.71 
 
 
471 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  26.44 
 
 
135 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  31 
 
 
141 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  30.53 
 
 
147 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  29.57 
 
 
137 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  38.33 
 
 
142 aa  46.2  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  28.89 
 
 
3075 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  34 
 
 
138 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  33.03 
 
 
151 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  38.33 
 
 
142 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>