94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5520 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  100 
 
 
291 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  50.17 
 
 
285 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  51.93 
 
 
289 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  48.62 
 
 
290 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.46 
 
 
286 aa  261  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  48.82 
 
 
297 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  48.82 
 
 
297 aa  258  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  46.88 
 
 
286 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  46.46 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  46.13 
 
 
297 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  48.72 
 
 
288 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  48.35 
 
 
288 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  44.79 
 
 
283 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  47.46 
 
 
291 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.32 
 
 
286 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  41.64 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  41.98 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  40.28 
 
 
286 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  46.24 
 
 
289 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  40.61 
 
 
286 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  44.79 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  44.15 
 
 
289 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  44.15 
 
 
289 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  42.47 
 
 
288 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  43.77 
 
 
289 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  37.37 
 
 
893 aa  163  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  38.73 
 
 
285 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  40.07 
 
 
286 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  40.07 
 
 
286 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  40.07 
 
 
286 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  40.3 
 
 
290 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  37.31 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  36.92 
 
 
286 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
710 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  38.19 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  35.97 
 
 
288 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  36.86 
 
 
287 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35 
 
 
283 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  35.71 
 
 
276 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  36.4 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.92 
 
 
283 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  34.4 
 
 
901 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  37.1 
 
 
282 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.65 
 
 
278 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  33.46 
 
 
283 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  34.65 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  33.45 
 
 
903 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  32.61 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  31.18 
 
 
316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  32.4 
 
 
282 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 
283 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  28.31 
 
 
295 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  29.43 
 
 
290 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  28.73 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  39.56 
 
 
135 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  42.03 
 
 
135 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  42.03 
 
 
135 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  42.03 
 
 
146 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  33.06 
 
 
2111 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  25.41 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  36.04 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  26.09 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  26.02 
 
 
3097 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  26.29 
 
 
3087 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12545  fatty acid synthase fas  26.36 
 
 
3069 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.696473  decreased coverage  0.00343939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2239  dehydratase  30.77 
 
 
138 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.12703  normal  0.929294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  38.27 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  34.34 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  25.09 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  29.2 
 
 
3077 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  29.03 
 
 
3075 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  29.2 
 
 
3077 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  33.33 
 
 
157 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0370  MaoC domain protein dehydratase  42.59 
 
 
130 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.758804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  26.84 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  35.9 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  30.86 
 
 
140 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1315  MaoC domain protein dehydratase  25.66 
 
 
3102 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  32.32 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  34.57 
 
 
127 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  33.33 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  35.35 
 
 
138 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  33.33 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1317  hypothetical protein  24.14 
 
 
452 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  32.47 
 
 
1872 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  42.11 
 
 
134 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  37.1 
 
 
131 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  28.44 
 
 
149 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3533  MaoC domain protein dehydratase  42.11 
 
 
138 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  29.73 
 
 
146 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  35.71 
 
 
343 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  32 
 
 
142 aa  42.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>