172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5004 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  100 
 
 
286 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  83.57 
 
 
286 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  82.52 
 
 
286 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  83.22 
 
 
286 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  77.27 
 
 
286 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  57.69 
 
 
283 aa  339  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  43.79 
 
 
285 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  43.66 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  43.33 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  40.07 
 
 
291 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  37.15 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  43.66 
 
 
290 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.91 
 
 
286 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  41.98 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  41.98 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  41.98 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  43.96 
 
 
286 aa  188  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  39.04 
 
 
291 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  41.64 
 
 
286 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.65 
 
 
289 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  42.65 
 
 
286 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  38.33 
 
 
297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  44.07 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  40.78 
 
 
287 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.57 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  43.02 
 
 
289 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  43.02 
 
 
289 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  43.02 
 
 
289 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  40.57 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  42.8 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  45.11 
 
 
289 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.27 
 
 
297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  43.32 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  35.59 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
710 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  41.2 
 
 
290 aa  158  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.21 
 
 
282 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  37.76 
 
 
276 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  33.45 
 
 
901 aa  146  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.89 
 
 
278 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  36.76 
 
 
282 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.96 
 
 
283 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  31.45 
 
 
893 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  32.49 
 
 
903 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  32.73 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  33.81 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  34.55 
 
 
288 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  29.86 
 
 
283 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  32.97 
 
 
265 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  31.29 
 
 
316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 
295 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  31.12 
 
 
283 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  28.57 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  28.98 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  32.42 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  23.49 
 
 
317 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  27.8 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 
1872 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  32.77 
 
 
141 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  38.57 
 
 
133 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  32 
 
 
140 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  40 
 
 
471 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  34.92 
 
 
2111 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  31.62 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  31.36 
 
 
127 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  31.62 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  31.62 
 
 
147 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2239  dehydratase  35.29 
 
 
138 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.12703  normal  0.929294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  32.08 
 
 
139 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0417  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  29.82 
 
 
467 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
138 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  30.95 
 
 
150 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  29.7 
 
 
133 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  34.04 
 
 
156 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  38.46 
 
 
146 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  31.86 
 
 
143 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
135 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  36.71 
 
 
184 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  35.24 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  35.24 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  35.4 
 
 
144 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  35.24 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  22.62 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  39.73 
 
 
163 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3371  MaoC domain-containing protein  25.23 
 
 
141 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  27.78 
 
 
135 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1315  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 
3102 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  30.89 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  39.19 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  32.97 
 
 
343 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  31.76 
 
 
166 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1994  MaoC domain protein dehydratase  31.74 
 
 
3083 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  35.9 
 
 
132 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
135 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  29.37 
 
 
142 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  36.62 
 
 
135 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  27.93 
 
 
139 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  36.71 
 
 
470 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  33.55 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  29.57 
 
 
147 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>