104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13423 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  100 
 
 
290 aa  584  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  74.91 
 
 
288 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  72.57 
 
 
291 aa  411  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  71.08 
 
 
289 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  71.08 
 
 
289 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  70.73 
 
 
289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.83 
 
 
283 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  40.8 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.8 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  40.4 
 
 
286 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  40.14 
 
 
285 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  39.93 
 
 
288 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  39.85 
 
 
893 aa  172  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  39.43 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
710 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  39.31 
 
 
288 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  44.4 
 
 
282 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  40.91 
 
 
290 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.27 
 
 
286 aa  169  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  39.4 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.45 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  40.48 
 
 
282 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.08 
 
 
287 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  40.3 
 
 
291 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  41.2 
 
 
286 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.41 
 
 
297 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  37.82 
 
 
903 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.14 
 
 
289 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.28 
 
 
286 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  40.52 
 
 
285 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  38.54 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  38.17 
 
 
286 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  38.17 
 
 
286 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  38.17 
 
 
286 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.7 
 
 
283 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  40.07 
 
 
276 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  40.91 
 
 
286 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  41.7 
 
 
286 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  37.8 
 
 
278 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  37.05 
 
 
286 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  38.8 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  38.16 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  35.94 
 
 
901 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  36.82 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.25 
 
 
283 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  34.31 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  38.66 
 
 
289 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  31.16 
 
 
283 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  29.64 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  33.59 
 
 
316 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  29.9 
 
 
290 aa  109  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  31.05 
 
 
297 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  29.81 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  37.38 
 
 
1872 aa  56.2  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1315  MaoC domain protein dehydratase  26.49 
 
 
3102 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  41.35 
 
 
131 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46430  hypothetical protein  36.46 
 
 
158 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  36.89 
 
 
150 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  31.16 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  44.78 
 
 
135 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  44.78 
 
 
135 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  27.54 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  44.78 
 
 
146 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  35.48 
 
 
144 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  35.48 
 
 
144 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  35.48 
 
 
144 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  32.58 
 
 
169 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  38.78 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  37.18 
 
 
127 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  40.3 
 
 
135 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  37.11 
 
 
141 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  37.11 
 
 
141 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  37.11 
 
 
141 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1081  dehydratase  27.84 
 
 
135 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  38.61 
 
 
145 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  26.87 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  32.67 
 
 
3097 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  32.67 
 
 
3087 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  28.41 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  29.53 
 
 
147 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3627  MaoC domain protein dehydratase  37.04 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  34.12 
 
 
154 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
140 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07873  fatty acid synthase beta subunit, putative (JCVI)  33.7 
 
 
2111 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826849  normal  0.601951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  26.37 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  41.67 
 
 
130 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  30.34 
 
 
190 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04370  fatty-acid synthase complex protein, putative  26.04 
 
 
2513 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  25.23 
 
 
134 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  27.11 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  41.67 
 
 
130 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0858  putative dehydratase  35.35 
 
 
127 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586377  normal  0.419357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  31.82 
 
 
184 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  37.68 
 
 
3077 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  37.68 
 
 
3077 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3661  fatty acid synthase  37.68 
 
 
3075 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  35.06 
 
 
133 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>