192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1221 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
148 aa  291  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0287  dehydratase  50 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  35.94 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  33.82 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  36.44 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  34.11 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  34.13 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  34.51 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  39.32 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  35.16 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  40.19 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  29.01 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  32.74 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  27.48 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  33.33 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  32.28 
 
 
137 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
620 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  32.82 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  39.76 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  30.71 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  34 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  39.32 
 
 
135 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  40.19 
 
 
135 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  30.47 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  31.86 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  29.01 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  35.23 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3256  MaoC domain protein dehydratase  38.57 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  41.89 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  26.77 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3533  MaoC domain protein dehydratase  43.48 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  38.64 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27147  predicted protein  34.95 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.476921  normal  0.54758 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29762  predicted protein  34.95 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.361137  hitchhiker  0.00732507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  29.01 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1493  dehydratase  28.57 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0447243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  38.37 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  40 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  33.33 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  33.33 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  30.3 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  32.06 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  26.24 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  32.04 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  28.26 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  33.33 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  32.04 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  32.04 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0994  dehydrogenase  27.82 
 
 
134 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0580228  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0409  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.11 
 
 
480 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.935296  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  34.82 
 
 
343 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7293  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.93 
 
 
472 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  28.69 
 
 
322 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  30.47 
 
 
332 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  30.47 
 
 
332 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  29.66 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  31.15 
 
 
326 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  33.08 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  37.5 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  34.41 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  29.09 
 
 
337 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  35.79 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  32.41 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  27.86 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  36.45 
 
 
343 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  27.86 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  36.45 
 
 
343 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  33.33 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  33.04 
 
 
343 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  29.66 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  36.45 
 
 
343 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  27.86 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  40.23 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  34.48 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  36.47 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0370  MaoC domain protein dehydratase  30.7 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.758804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  32.65 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  40 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  31.09 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  31.36 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  30.09 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1026  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.23 
 
 
472 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  29.79 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  28.81 
 
 
147 aa  48.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  37.21 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  40 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  35.64 
 
 
339 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  32.82 
 
 
335 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  34.74 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  32 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.09 
 
 
481 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6428  MaoC-like dehydratase  27.06 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.632937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1127  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.62 
 
 
472 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  33.33 
 
 
3097 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  29.85 
 
 
500 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.09 
 
 
481 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  35.29 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  34.86 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2915  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.2 
 
 
473 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>