204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3988 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  100 
 
 
136 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  66.17 
 
 
138 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  66.17 
 
 
138 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  65.41 
 
 
138 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  57.78 
 
 
138 aa  153  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  58.65 
 
 
138 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  57.04 
 
 
138 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  54.89 
 
 
139 aa  151  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  55.15 
 
 
138 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  54.96 
 
 
139 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  54.41 
 
 
137 aa  148  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  53.03 
 
 
141 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  51.91 
 
 
149 aa  139  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  51.15 
 
 
140 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  47.79 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  48.85 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  50 
 
 
137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  52 
 
 
141 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  46.56 
 
 
141 aa  116  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  43.08 
 
 
326 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  40.62 
 
 
322 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  42.54 
 
 
332 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  42.54 
 
 
332 aa  96.7  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  37.21 
 
 
141 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  37.21 
 
 
141 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  37.21 
 
 
141 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  39.39 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  42.05 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  48.28 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  49.3 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  35.59 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  42.05 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  38.06 
 
 
335 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  41.67 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  39.85 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  41.23 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  51.22 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  39.1 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  48.19 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  38.24 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  36.89 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  36.43 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  53.85 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  51.39 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  48.78 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  39.26 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  47.22 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  49.28 
 
 
343 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  49.28 
 
 
343 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  49.28 
 
 
343 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  43.66 
 
 
343 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  47.83 
 
 
343 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  40.96 
 
 
163 aa  60.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  48.28 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  46.38 
 
 
339 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  46.55 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  43.82 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  34.97 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.07 
 
 
481 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  42.65 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.07 
 
 
481 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  36.7 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  40.48 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  41.25 
 
 
150 aa  57  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  39.55 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  38.06 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  42.35 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  39.08 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  36.73 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  39.78 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  40.45 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  40.45 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  35.25 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  33 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  31.93 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  26.72 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  34.68 
 
 
147 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  40.28 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  29.69 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
620 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  47.62 
 
 
279 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0287  dehydratase  33.33 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  29.57 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  29.57 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  28.03 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  29.82 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  31.25 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  39.13 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  31.09 
 
 
144 aa  48.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  41.27 
 
 
297 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  29.57 
 
 
147 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  28.89 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  27.34 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  26.95 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  25.58 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  31.63 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  31.63 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>