130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4070 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  100 
 
 
147 aa  293  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6628  dehydratase  58.93 
 
 
126 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.211111  normal  0.931834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  39.5 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  32.29 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  27.64 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  29.79 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  31.62 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  32.11 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  32.77 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  34.41 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  39.24 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  31.72 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  30.95 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  30.95 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  30.95 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  33.05 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  32.43 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2143  hypothetical protein  35.29 
 
 
300 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  32.19 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  34.23 
 
 
141 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  32.65 
 
 
322 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  36.25 
 
 
163 aa  50.4  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  36.92 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0575  hypothetical protein  32.91 
 
 
282 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370327  normal  0.299946 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  30.84 
 
 
337 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  33.67 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  31.76 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  31.71 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  30 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  32.48 
 
 
142 aa  48.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  28.81 
 
 
148 aa  48.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  30.77 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  35.14 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  38.46 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  28.15 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  28.15 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  28.15 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  30.48 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0045  dehydratase  32.56 
 
 
306 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  26.8 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  31.43 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  31.65 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4091  hypothetical protein  32.84 
 
 
431 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  31.63 
 
 
332 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  28.79 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  31.63 
 
 
332 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  30.93 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  36.92 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  31.63 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  34.29 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  28.7 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  34.29 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  30.7 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  35.44 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  36 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46430  hypothetical protein  26.89 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0584  hypothetical protein  32.2 
 
 
294 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  31.25 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  30.26 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  30.36 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  27.27 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  25.2 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7300  hypothetical protein  32.05 
 
 
285 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0499  hypothetical protein  28.81 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718353  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  31.82 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  33.33 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1241  hypothetical protein  34.94 
 
 
294 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.271963  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  26 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  31.65 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  31.65 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  30.95 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  25.64 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3275  dehydratase  26.19 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4485  MaoC like domain-containing protein  25.76 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4332  MaoC family protein  25.76 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4836  MaoC-like domain-containing protein  25.76 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  29.59 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0187  dehydratase  30.21 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.771388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  27.1 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  24.69 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0784  MaoC domain protein dehydratase  29.27 
 
 
155 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1800  hypothetical protein  38.98 
 
 
285 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4320  MaoC family protein  25.76 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  25 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3937  hypothetical protein  38.98 
 
 
285 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  34.18 
 
 
343 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  27.66 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4177  hypothetical protein  34.26 
 
 
282 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0908  hypothetical protein  34.23 
 
 
284 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.786085  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4421  dehydratase  26.52 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4717  maoC like domain protein  25.76 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0537  maoC like domain protein  25.76 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177379 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4706  maoC like domain protein  25.76 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000025944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  27.37 
 
 
146 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3538  hypothetical protein  30.25 
 
 
287 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0563  MaoC domain protein dehydratase  31.17 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.127994  normal  0.0650042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3697  hypothetical protein  38.98 
 
 
291 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  28 
 
 
177 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  29.27 
 
 
142 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>