51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3857 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  280  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  65.08 
 
 
133 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  65.08 
 
 
133 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  65.08 
 
 
133 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  64.8 
 
 
133 aa  167  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  64.29 
 
 
143 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  64.23 
 
 
141 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  64.41 
 
 
129 aa  163  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  61.29 
 
 
129 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  61.16 
 
 
129 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  54.14 
 
 
136 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  57.36 
 
 
143 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  56.91 
 
 
126 aa  140  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  55.74 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  49.59 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  40.91 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  41.12 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  32 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  32.14 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  32.14 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  32.14 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  30.08 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  36.7 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4070  dehydratase  32.77 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.353484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  28.93 
 
 
141 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  29.46 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  28.99 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  32.84 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  28.47 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  31.82 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  27.74 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  26.23 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  27.54 
 
 
343 aa  43.5  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  29.75 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  30.48 
 
 
337 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  27.27 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  28.83 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  32.39 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  28.83 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  32.39 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  32.39 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  30.43 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  28.83 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  31.46 
 
 
326 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  30.53 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  27.54 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  28.68 
 
 
343 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  28.68 
 
 
343 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  28.68 
 
 
343 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  23.19 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  29.5 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>