51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2140 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2140  dehydratase  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3480  MaoC domain protein dehydratase  48.85 
 
 		 143 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0062  MaoC domain protein dehydratase  49.19 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3857  hypothetical protein  40.91 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2787  dehydratase  45.6 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2820  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8195  dehydratase  43.41 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2622  hypothetical protein  43.65 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0241614  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4673  MaoC-like dehydratase  42.06 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4759  dehydratase  42.06 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.533729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5254  MaoC-like dehydratase  42.06 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1512  dehydratase  41.73 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5058  MaoC-like dehydratase  44.17 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0886  hypothetical protein  43.2 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3320  dehydratase  43.08 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000697318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13574  hypothetical protein  40.32 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5359  MaoC domain protein dehydratase  32.04 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3209  MaoC-like dehydratase  30.77 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205501  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3271  dehydratase  30.77 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3220  dehydratase  30.77 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1231  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.9 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5120  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.9 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.06 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  28.57 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1483  hypothetical protein  29.41 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000382942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1853  hypothetical protein  29.9 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0381844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  27.86 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  28.68 
 
 		 343 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  28.68 
 
 		 343 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  28.68 
 
 		 343 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  27.87 
 
 		 339 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  26.23 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0512  hypothetical protein  31.46 
 
 		 326 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  32.11 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  32.11 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0947  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  30.15 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  32.11 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  28.32 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0936  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  29.41 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0919  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  29.41 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0891029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  24.79 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  29.91 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  26.83 
 
 		 352 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  29.6 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  27.38 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  28.15 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  25.96 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  23.14 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  25.6 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>