More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8223 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  38.57 
 
 
146 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  40.28 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  35 
 
 
146 aa  94  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4965  dehydratase  34.21 
 
 
183 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  33.78 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  38.03 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  32.87 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  36.55 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  37.32 
 
 
148 aa  87.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  36.73 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  43.2 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  39.31 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  35.37 
 
 
150 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  36.5 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  37.5 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  39.1 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  35.88 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  38.35 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  35.42 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  34.25 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  34.53 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  37.82 
 
 
168 aa  80.1  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  38.64 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  38.64 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  35.43 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  33.59 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  36.94 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  37.91 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  37.58 
 
 
686 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  37.01 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  34.93 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  34.46 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  32.41 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  36.05 
 
 
679 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  34.07 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2275  dehydratase  31.51 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  37.38 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  33.59 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  33.1 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  34.84 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  31.25 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  34.23 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  33.85 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  35.66 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  35.66 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  29.8 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  29.17 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  31.97 
 
 
344 aa  70.5  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  36.91 
 
 
172 aa  70.1  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  35.66 
 
 
216 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  32.48 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  33.79 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  31.21 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  36.24 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  34.31 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  33.57 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  36.21 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  35.61 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  33.1 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  33.1 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  36.49 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  33.1 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  33.05 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6428  MaoC-like dehydratase  32.52 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.632937  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  31.54 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  30.95 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  34.42 
 
 
173 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  28.48 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  32.19 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  30.95 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  30.2 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  32 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  31.03 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  31.33 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  31.88 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  28.87 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.13 
 
 
690 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  34.48 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  31.33 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  31.33 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  30.46 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 
690 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  30.34 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  31.93 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  35.34 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  33.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  34.72 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  30.2 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  32.17 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  32.17 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  32.17 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  32.17 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  32.17 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  32.17 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  32.17 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  28.91 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  31.54 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  28.17 
 
 
174 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  29.8 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>