178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4965 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4965  dehydratase  100 
 
 		 183 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2275  dehydratase  66.26 
 
 		 167 aa  231  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  41.5 
 
 		 148 aa  95.9  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  38.36 
 
 		 154 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  34.21 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  37.96 
 
 		 147 aa  91.7  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  36.62 
 
 		 146 aa  89.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  36.62 
 
 		 146 aa  87.8  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  36.81 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  34.67 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  31.51 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 		 686 aa  71.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  32.35 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  32.89 
 
 		 686 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  32 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  32.41 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  33.57 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 		 684 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 		 684 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.28 
 
 		 683 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  32.86 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  35.71 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  30.34 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34 
 
 		 684 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 683 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 684 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  33.08 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  33.59 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  29.66 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  31.82 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 683 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 682 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.99 
 
 		 681 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  31.82 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  31.76 
 
 		 152 aa  62  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  31.06 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.07 
 
 		 695 aa  62  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  28.38 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.99 
 
 		 681 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.99 
 
 		 681 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  32.61 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 		 690 aa  61.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  31.78 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  30.94 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  26.59 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  31.34 
 
 		 679 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  26.67 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 681 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  30.3 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  31.01 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  29.93 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1326  MaoC domain protein dehydratase  30.65 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  29.55 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  29.75 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  29.75 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  29.75 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  26.53 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  28.46 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  27.52 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6842  dehydratase  27.14 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3627  MaoC domain protein dehydratase  27.54 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  31.34 
 
 		 690 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0913  dehydratase  28.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6428  MaoC-like dehydratase  41.86 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.632937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4037  MaoC domain protein dehydratase  28.8 
 
 		 348 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  31.62 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  27.48 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4075  MaoC domain protein dehydratase  28 
 
 		 348 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3781  dehydratase  28 
 
 		 348 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  31.43 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4172  dehydratase  28.77 
 
 		 353 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  31.34 
 
 		 836 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  26.81 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  24.83 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  27.94 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  29.85 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  29.85 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  30.88 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.244814 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.66 
 
 		 664 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  29.73 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  24.29 
 
 		 150 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  30.15 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  32.43 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  28 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  29.29 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  29.55 
 
 		 344 aa  50.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 687 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  32.62 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  34.31 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  27.86 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  31.62 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1289  MaoC-like dehydratase  31.01 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  30.15 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  29.93 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  29.41 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 		 685 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3940  dehydratase  29.6 
 
 		 348 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  28.93 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>