More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2683 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  100 
 
 		 154 aa  321  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  65.99 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  65.97 
 
 		 166 aa  208  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  67.12 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  70.75 
 
 		 150 aa  206  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  65.75 
 
 		 150 aa  207  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  65.75 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  64.24 
 
 		 150 aa  200  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  63.09 
 
 		 150 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  59.72 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  57.72 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  56.67 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  57.05 
 
 		 150 aa  170  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  56.38 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  55.56 
 
 		 185 aa  167  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  53.25 
 
 		 153 aa  167  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  54.79 
 
 		 150 aa  166  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  54.67 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  61.22 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  54.79 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  53.06 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  53.06 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  53.06 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  53.69 
 
 		 149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  51.97 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  52.98 
 
 		 177 aa  161  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  53.69 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  56.25 
 
 		 169 aa  160  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  53.69 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  51.7 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  51.7 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  52.7 
 
 		 175 aa  154  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  51.39 
 
 		 176 aa  153  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  53.06 
 
 		 186 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  50.34 
 
 		 165 aa  147  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  49.02 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  51.05 
 
 		 168 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  46.26 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  46.26 
 
 		 168 aa  140  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  48.37 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  46.98 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  46.98 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  46.98 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  46.98 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  46.98 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  46.98 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  46.98 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  44.22 
 
 		 169 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  47.3 
 
 		 199 aa  132  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  45.7 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  46.1 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  46.26 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  46.26 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  46.75 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  42.67 
 
 		 172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  44.3 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  44.97 
 
 		 175 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  45.77 
 
 		 156 aa  123  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  44.97 
 
 		 175 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  44.97 
 
 		 216 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  45.71 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  45.71 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  48.8 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  44 
 
 		 174 aa  120  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  45.27 
 
 		 175 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  45.27 
 
 		 175 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  45.27 
 
 		 175 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  45.27 
 
 		 175 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  42.67 
 
 		 174 aa  114  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  42.76 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  39.86 
 
 		 344 aa  114  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  43.57 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  40.82 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  41.45 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  42.86 
 
 		 184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  40.14 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  40.79 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  40.79 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  40.13 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  39.58 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  40.79 
 
 		 177 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  41.13 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  36.49 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  39.86 
 
 		 174 aa  96.7  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  37.91 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  36.84 
 
 		 166 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  36.91 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  34.46 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2185  MaoC domain protein dehydratase  40.44 
 
 		 348 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0004362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  35.29 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  33.78 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  32.61 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7163  MaoC-like dehydratase  32.85 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0834  putative dehydratase  32.65 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0152637 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 681 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  36.17 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  36.23 
 
 		 681 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 		 681 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  34.53 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>