More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2706 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  92.67 
 
 
150 aa  293  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  65.75 
 
 
154 aa  207  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  60.67 
 
 
150 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  61.74 
 
 
150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  60 
 
 
150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  58.67 
 
 
169 aa  184  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  58 
 
 
150 aa  183  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  57.33 
 
 
150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  57.72 
 
 
166 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  57.05 
 
 
149 aa  177  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  54.42 
 
 
149 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  56.67 
 
 
153 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  54.67 
 
 
159 aa  175  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  54 
 
 
150 aa  175  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  56.08 
 
 
149 aa  173  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  54 
 
 
153 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  53.69 
 
 
150 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  55.17 
 
 
150 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  52 
 
 
150 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  53.06 
 
 
170 aa  167  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  51.35 
 
 
169 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  54.05 
 
 
161 aa  153  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  49.31 
 
 
176 aa  150  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  50.68 
 
 
177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  47.3 
 
 
161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  47.3 
 
 
161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  47.3 
 
 
161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  47.3 
 
 
164 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  45.89 
 
 
159 aa  141  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  47.3 
 
 
164 aa  140  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  50 
 
 
175 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  50 
 
 
175 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  50 
 
 
175 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  50 
 
 
175 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  50 
 
 
175 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  50 
 
 
175 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  50 
 
 
175 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  47.97 
 
 
185 aa  140  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  49.66 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  44.06 
 
 
165 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  43.24 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  48.65 
 
 
216 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  48.65 
 
 
175 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  48.65 
 
 
175 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  42.57 
 
 
186 aa  133  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  44.52 
 
 
168 aa  131  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  44.52 
 
 
168 aa  131  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  45.95 
 
 
160 aa  130  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  46.58 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  42.67 
 
 
152 aa  128  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  46.58 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  45.07 
 
 
168 aa  127  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  43.15 
 
 
169 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  46.58 
 
 
166 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  45.21 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  47.59 
 
 
175 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  47.59 
 
 
175 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  47.59 
 
 
175 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  47.59 
 
 
175 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  42.95 
 
 
152 aa  124  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  43.62 
 
 
175 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  44.52 
 
 
174 aa  123  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  43.24 
 
 
172 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  41.96 
 
 
184 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  42.11 
 
 
155 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  41.96 
 
 
184 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  41.38 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  41.38 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  43.92 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  41.78 
 
 
344 aa  115  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  38.96 
 
 
161 aa  114  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  37.91 
 
 
156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  39.73 
 
 
199 aa  113  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  40.56 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  40.69 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  40 
 
 
163 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  39.6 
 
 
172 aa  103  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  38.78 
 
 
169 aa  103  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  38.78 
 
 
190 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  38.1 
 
 
169 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  38.36 
 
 
166 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  35.37 
 
 
171 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  35.37 
 
 
171 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  36.3 
 
 
174 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  34.69 
 
 
167 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2185  MaoC domain protein dehydratase  40.74 
 
 
348 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0004362  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  35.62 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  34.01 
 
 
169 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0834  putative dehydratase  38.26 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0152637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  36.24 
 
 
162 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  35.71 
 
 
160 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0973  MaoC family protein  33.33 
 
 
343 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2633  dehydratase  33.33 
 
 
343 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  32.65 
 
 
343 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7163  MaoC-like dehydratase  34.67 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  33.56 
 
 
344 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2871  putative thiol ester dehydrase/isomerase  35.29 
 
 
343 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  37.58 
 
 
157 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  37.33 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>