More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0607 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  100 
 
 		 150 aa  312  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  91.33 
 
 		 150 aa  290  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  66.44 
 
 		 150 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  62.67 
 
 		 169 aa  202  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  62.42 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  64.24 
 
 		 154 aa  200  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  60.81 
 
 		 150 aa  199  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  61.74 
 
 		 150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  61.07 
 
 		 150 aa  191  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  55.33 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  54.05 
 
 		 149 aa  173  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  52.7 
 
 		 150 aa  173  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  55.03 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  53.69 
 
 		 153 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  56.55 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  53.69 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  59.18 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  52.38 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  52.7 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  51.68 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  53.02 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  52.38 
 
 		 170 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  52.7 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  50.67 
 
 		 185 aa  156  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  50 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  50 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  50 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  50 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  49.32 
 
 		 164 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  47.26 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  48.63 
 
 		 177 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  44.97 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  47.65 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  47.26 
 
 		 169 aa  143  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  45.21 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  47.65 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  45.95 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  47.89 
 
 		 168 aa  140  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  45.89 
 
 		 186 aa  140  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  47.3 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  47.3 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  47.3 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  47.3 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  47.3 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  47.3 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  44.52 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  47.3 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  44.52 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  44.59 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  44.76 
 
 		 176 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  46.36 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  44.14 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  44.14 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  43.84 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  43.84 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  44.52 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  41.83 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  41.78 
 
 		 199 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  43.15 
 
 		 172 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  44.22 
 
 		 175 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  45.21 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  45.21 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  45.21 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  44.52 
 
 		 175 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  44.06 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  43.84 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  43.24 
 
 		 175 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  44.52 
 
 		 174 aa  118  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  43.24 
 
 		 175 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  43.24 
 
 		 216 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  37.67 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  42.18 
 
 		 169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  39.46 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  44.03 
 
 		 184 aa  114  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  46.56 
 
 		 163 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  38.78 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  43.15 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  38.78 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  40.14 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  39.73 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  40.14 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  42.54 
 
 		 184 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  40 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  39.73 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  38.78 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  38.78 
 
 		 172 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  37.5 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  35.81 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  38.93 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  37.41 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  36.6 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2185  MaoC domain protein dehydratase  40.56 
 
 		 348 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0004362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7163  MaoC-like dehydratase  33.56 
 
 		 167 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  34.93 
 
 		 166 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  35.14 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  33.79 
 
 		 344 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  31.08 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  36.05 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>