More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2043 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  327  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  79.87 
 
 		 161 aa  276  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  79.22 
 
 		 161 aa  274  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  69.86 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  63.7 
 
 		 149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  53.42 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  51.02 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  51.37 
 
 		 152 aa  167  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  50.7 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  50.68 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  50.35 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1149  MoaC domain-containing protein  48.59 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.58838  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1810  MoaC domain-containing protein  48.59 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  48.59 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1455  MoaC domain-containing protein  48.59 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  48.59 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  48.59 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0432  MoaC domain-containing protein  48.59 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  50.35 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2815  MaoC domain protein dehydratase  52.78 
 
 		 334 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  47.92 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  49.3 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5558  MaoC-like dehydratase  48.59 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2414  MaoC domain protein dehydratase  53.19 
 
 		 332 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2601  dehydratase  46.85 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  51.39 
 
 		 334 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  47.89 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1618  MaoC-like dehydratase  45.03 
 
 		 167 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2230  dehydratase  45.03 
 
 		 167 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  46.58 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2268  dehydratase  47.18 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  49.66 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2709  MaoC domain protein dehydratase  51.77 
 
 		 332 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2486  dehydratase  51.77 
 
 		 352 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2147  dehydratase  45.77 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159813  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1835  MaoC domain protein dehydratase  50.77 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0897261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  46.62 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  45.83 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4342  MaoC domain protein dehydratase  45.52 
 
 		 180 aa  140  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2796  MaoC domain protein dehydratase  45.52 
 
 		 145 aa  140  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  46.21 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3037  MaoC domain protein dehydratase  46.48 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  44.44 
 
 		 334 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2268  dehydratase  47.92 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276096  normal  0.630961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1771  hypothetical protein  42.76 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2773  MaoC domain protein dehydratase  46.56 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3099  MaoC-like dehydratase  41.22 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4156  MaoC-like dehydratase  42.31 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.717491  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3196  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  45.21 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3997  MaoC-like dehydratase  41.67 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3664  dehydratase  46.76 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2253  dehydratase  42.68 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350029  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4836  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2160  MaoC-like dehydratase  43.45 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4157  MaoC-like dehydratase  40.97 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.967717  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  44.6 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  43.45 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  40.52 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3996  MaoC-like dehydratase  40.91 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  39.49 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0225  MaoC-like dehydratase  44.6 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  42.21 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  42.36 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3961  MaoC domain protein dehydratase  48.7 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  43.45 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  43.75 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1628  dehydratase  41.48 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  42.47 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  41.56 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1487  maoC-related protein  41.48 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1538  maoC-related protein  41.48 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0790227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  42.21 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3813  MaoC domain protein dehydratase  43.45 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2508  MaoC-like dehydratase  38.73 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  41.5 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  41.67 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4164  MaoC domain protein dehydratase  40.69 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  37.18 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  41.67 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  40 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1627  dehydratase  37.18 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  40.25 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  40.97 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2600  dehydratase  35.71 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1419  MaoC-like dehydratase  42.07 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.982529  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1420  MaoC-like dehydratase  37.01 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.788165  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1809  dehydratase  37.59 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0834383  normal  0.792889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1772  hypothetical protein  38.96 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4123  dehydratase  40.85 
 
 		 329 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2161  MaoC-like dehydratase  41.91 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2490  MaoC domain protein dehydratase  40.56 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2774  MaoC domain protein dehydratase  39.86 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0800  MaoC domain-containing protein dehydratase  36.3 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2269  dehydratase  39.13 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265677  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2249  dehydratase  40.43 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  0.226342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3197  hypothetical protein  36.24 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3038  MaoC domain protein dehydratase  36.96 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.724485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2604  dehydratase  39.55 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.836976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  32.89 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>