222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3997 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3997  MaoC-like dehydratase  100 
 
 		 155 aa  324  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4157  MaoC-like dehydratase  88.74 
 
 		 156 aa  288  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.967717  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4836  MaoC domain protein dehydratase  77.92 
 
 		 160 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1771  hypothetical protein  76.71 
 
 		 153 aa  244  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3099  MaoC-like dehydratase  72.6 
 
 		 153 aa  229  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2508  MaoC-like dehydratase  68.28 
 
 		 153 aa  216  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1419  MaoC-like dehydratase  68.92 
 
 		 151 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.982529  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2601  dehydratase  48.59 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  48 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2160  MaoC-like dehydratase  47.3 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2773  MaoC domain protein dehydratase  49.31 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1628  dehydratase  46.15 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  44.37 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  41.78 
 
 		 334 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3037  MaoC domain protein dehydratase  49.62 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  43.66 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_004310  BR1538  maoC-related protein  42.67 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0790227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1487  maoC-related protein  43.33 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  41.67 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  44.22 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  44.52 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2268  dehydratase  42.28 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276096  normal  0.630961 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1810  MoaC domain-containing protein  40.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1455  MoaC domain-containing protein  40.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1149  MoaC domain-containing protein  40.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.58838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  40.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  40.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  40.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0432  MoaC domain-containing protein  40.28 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2414  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 		 332 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2815  MaoC domain protein dehydratase  45.07 
 
 		 334 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  41.78 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4342  MaoC domain protein dehydratase  41.61 
 
 		 180 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  40.54 
 
 		 172 aa  126  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  42.36 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  43.8 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2709  MaoC domain protein dehydratase  39.33 
 
 		 332 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2486  dehydratase  39.33 
 
 		 352 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  40.27 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  47.58 
 
 		 334 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  40.28 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  42.36 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3196  hypothetical protein  41.61 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  42.96 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  40.28 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  40.82 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  37.84 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  41.48 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  37.5 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  39.04 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2796  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5558  MaoC-like dehydratase  36.55 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1835  MaoC domain protein dehydratase  44.35 
 
 		 133 aa  113  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0897261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2268  dehydratase  36.55 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  35.86 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  38.46 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2147  dehydratase  35.86 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159813  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2490  MaoC domain protein dehydratase  39.31 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4123  dehydratase  39.44 
 
 		 329 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1618  MaoC-like dehydratase  35.86 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2230  dehydratase  35.86 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3664  dehydratase  38.52 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  35.17 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  40.97 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  36.81 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  38.19 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  36.51 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0225  MaoC-like dehydratase  34.07 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  35.06 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  36.73 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3961  MaoC domain protein dehydratase  41.03 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  34.93 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  35.92 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  34.48 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  33.99 
 
 		 160 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  34.64 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2161  MaoC-like dehydratase  37.68 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3996  MaoC-like dehydratase  35.29 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  34.03 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  34.35 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  36.59 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0800  MaoC domain-containing protein dehydratase  39.66 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3813  MaoC domain protein dehydratase  33.11 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4156  MaoC-like dehydratase  34.84 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.717491  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1420  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.788165  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4164  MaoC domain protein dehydratase  32.58 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3197  hypothetical protein  34.06 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2253  dehydratase  35.06 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350029  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1809  dehydratase  31.51 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0834383  normal  0.792889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2269  dehydratase  34.31 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265677  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  29.37 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2600  dehydratase  29.41 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2604  dehydratase  41.53 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.836976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2774  MaoC domain protein dehydratase  29.73 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  31.43 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1627  dehydratase  30.94 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3038  MaoC domain protein dehydratase  28.38 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.724485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  31.58 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0028  dehydratase  26.52 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>