228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2268 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2268  dehydratase  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276096  normal  0.630961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3037  MaoC domain protein dehydratase  63.89 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2773  MaoC domain protein dehydratase  61.11 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3196  hypothetical protein  57.24 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2160  MaoC-like dehydratase  58.22 
 
 		 154 aa  170  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1628  dehydratase  51.37 
 
 		 161 aa  163  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584563  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1487  maoC-related protein  48.59 
 
 		 166 aa  151  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  53.47 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_004310  BR1538  maoC-related protein  47.89 
 
 		 166 aa  150  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0790227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2601  dehydratase  50.67 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  48.32 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2815  MaoC domain protein dehydratase  46.53 
 
 		 334 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1771  hypothetical protein  46 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4836  MaoC domain protein dehydratase  43.92 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  47.92 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  44.83 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4157  MaoC-like dehydratase  44.14 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.967717  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  44.44 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  43.75 
 
 		 161 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3099  MaoC-like dehydratase  43.84 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3997  MaoC-like dehydratase  42.28 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2508  MaoC-like dehydratase  44.14 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2486  dehydratase  40.28 
 
 		 352 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  41.67 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2709  MaoC domain protein dehydratase  40.28 
 
 		 332 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  40.41 
 
 		 334 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  43.57 
 
 		 334 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2414  MaoC domain protein dehydratase  39.58 
 
 		 332 aa  124  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1810  MoaC domain-containing protein  39.33 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1455  MoaC domain-containing protein  39.33 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  42.07 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1149  MoaC domain-containing protein  39.33 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.58838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  39.33 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  39.33 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  39.33 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0432  MoaC domain-containing protein  39.33 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5558  MaoC-like dehydratase  41.38 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  42.67 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  40.54 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  42.68 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  38.62 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1618  MaoC-like dehydratase  37.93 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2230  dehydratase  37.93 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  41.33 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  39.86 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3996  MaoC-like dehydratase  40.13 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  39.74 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  42.76 
 
 		 159 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2268  dehydratase  39.31 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  42.86 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2147  dehydratase  39.31 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159813  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  42.95 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  38.93 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  39.31 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  38.51 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  39.58 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  38.36 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1419  MaoC-like dehydratase  39.86 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.982529  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  42.11 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4156  MaoC-like dehydratase  36.54 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.717491  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  38.36 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4342  MaoC domain protein dehydratase  39.58 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0800  MaoC domain-containing protein dehydratase  38.52 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3664  dehydratase  36.17 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4123  dehydratase  39.16 
 
 		 329 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  38.19 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  37.24 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  38.19 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0225  MaoC-like dehydratase  38.85 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2796  MaoC domain protein dehydratase  34.01 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1420  MaoC-like dehydratase  39.1 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.788165  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  37.32 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  37.93 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  38 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  36 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1772  hypothetical protein  37.58 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  39.16 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  34.85 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2253  dehydratase  36.31 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350029  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4164  MaoC domain protein dehydratase  34.25 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1627  dehydratase  34.85 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350519  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  32.41 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  36.11 
 
 		 165 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3961  MaoC domain protein dehydratase  36.97 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1835  MaoC domain protein dehydratase  40.52 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0897261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  34.93 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2600  dehydratase  34.81 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2269  dehydratase  35.95 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265677  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2161  MaoC-like dehydratase  37.4 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2490  MaoC domain protein dehydratase  32.64 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3197  hypothetical protein  33.1 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1809  dehydratase  32.65 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0834383  normal  0.792889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2604  dehydratase  39.23 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.836976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2774  MaoC domain protein dehydratase  33.85 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3813  MaoC domain protein dehydratase  33.56 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3038  MaoC domain protein dehydratase  29.73 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.724485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  29.25 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2249  dehydratase  33.33 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  0.226342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>